临床表现生殖道沙眼衣原体感染的临床表现特征是慢性经过。很多感染者无明显临床表现，但有可能引起严重的后遗症，也是主要的传染源。1.男性感染主要为尿道炎。潜伏期1～3周，临床表现为尿道黏液性或黏液脓性分泌物，并有尿痛、尿道不适等症状。合并症有附睾炎、前列腺炎等。附睾炎的临床表现是一侧的附睾疼痛、肿大，有触痛。炎症明显时，阴囊表面的皮肤充血、发红、水肿。有的患者并发睾丸炎，阴囊明显肿胀、潮红、剧痛、输精管变粗。前列腺炎可无明显症状，也可出现腰酸、下腹坠胀等。直肠炎主要发生在男性同性性行为者，尤其是被动肛交者中。临床表现轻者无症状，重者有直肠疼痛、出血、腹泻及黏液性分泌物。2.女性感染女性主要发生宫颈炎和尿道炎。70%～90%的妇女宫颈沙眼衣原体感染无症状，可持续数月至数年。有症状发生时，可出现阴道分泌物异常，非月经期或性交后出血。尿道炎的症状有排尿困难、尿频、尿急等。衣原体宫颈感染如不治疗，可向上发展发生盆腔炎。表现有下腹痛、性交痛等，长期持续的感染可导致不育、宫外孕（异位妊娠）和慢性下腹痛。孕妇的生殖道沙眼衣原体感染可增加早产、低出生体重和胎膜早破的危险性。如未经有效治疗，可传染新生儿，引起新生儿眼炎及肺炎。

1.涂片显微镜检查
可用于新生儿眼结膜刮片的检查，但不适用于泌尿生殖道沙眼衣原体感染的检查。
2.细胞培养法
此法是检测沙眼衣原体感染最为特异的方法，此法可用作证实试验和治疗后的判愈试验。需一定的实验设备。临床没有普遍开展。
3.直接免疫荧光法和酶联免疫吸附试验
是比较实用检测方法。但也存在敏感性不够的缺点，可能会漏检。
4.快速免疫层析试验
已有商品化试剂盒用于沙眼衣原体感染的快速诊断。结果可在半小时内得到。缺点敏感性不够。
5.核酸扩增试验
用于诊断沙眼衣原体感染的聚合酶链反应（PCR）已有商品化试剂盒。此法对于诊断泌尿生殖道沙眼衣原体感染敏感性和特异性都非常高。核酸检测应在通过相关机构认定的实验室开展。

临床上，沙眼衣原体感染常与淋球菌感染有紧密联系。这两种病原体均可引起男性尿道炎、附睾炎、直肠炎，女性宫颈炎、尿道炎、盆腔炎等，它们引起的疾病，其临床症状和体征差别不大，因此单凭临床观察是不易区分的。而且沙眼衣原体和淋球菌可合并感染。准确的鉴别诊断有赖于实验室检查。在临床实践中，常对确定为淋球菌感染者，无论是否检查沙眼衣原体感染，均常规给予抗淋球菌和沙眼衣原体两种病原体的治疗。

1.治疗原则沙眼衣原体感染的治疗目的是治愈感染，防止产生合并症，阻断进一步传播。治疗原则是早期发现，早期治疗，用药足量、足疗程。性伴需同时治疗。2.治疗方案目前对于成人沙眼衣原体尿道炎、宫颈炎、直肠炎，通常采用的治疗方案为：阿奇霉素，单剂口服，或多西环素，每日2次，共7～10日。其他可以选用的药物包括米诺环素、红霉素、四环素、罗红霉素、克拉霉素、氧氟沙星、左氧氟沙星、司帕沙星等。可以根据具体病情、药源等情况选择使用。3.性伴的处理在患者出现症状或确诊前的2个月内的所有性伴均应接受检查和治疗。病人及其性伴在完成治疗之前应避免性行为。

1.提倡行为的改变，如不搞非婚性行为，推迟首次性交年龄，减少性伴的数目，慎重选择性伴，使用安全套等。2.如果有非婚性行为或其他不安全的性行为，或者有可以的尿道症状、白带异常，应该及时去正规医院就诊，做相关的检查，及早诊断，及时治疗，避免发生合并症和后遗症。