眼部感染的潜伏期较长，病程发展较慢，临床诊断依靠病史及眼部体征，确诊须靠真菌检查。
可采用组织病理学、脱落细胞学、免疫荧光技术、电镜观察、核酸杂交和聚合酶链反应等直接检查病变标本中是否存在病毒颗粒或特异性抗原。微生物学检査等。

眼部感染易混淆的症状
急性结膜炎、真菌性角膜溃疡、淋菌性结膜炎、沙眼等。眼部感染的潜伏期较长，病程发展较慢。临床诊断依靠病史及眼部体征，确诊须靠真菌检。病毒分离培养是最特异的诊断方法，培养后应用酶免疫法或核酸探针技术检测培养物上清液中的反转录酶活性或检测病毒抗原。病毒的分离培养需在特定的实验室中进行。

抗生素的应用要选择有效的药物，依感染部位和轻重来决定用药方法。虽然先通过细菌培养确定感染菌种选定最敏感的抗生素，然后用药最可靠，在一般情况下，有很严重的感染可凭经验用药。使用于眼部的抗生素，最好选择不用或少用于全身感染的药物，以免发生过敏反应。例如：新霉素、杆菌肽、多粘菌素B等常被用于结膜炎的治疗。不过四环素、氯霉素、庆大霉素、磺胺醋酰、磺胺甲基异恶唑和环丙沙星等虽然用于全身感染，亦用于眼睛感染，很少发生过敏反应。对于比较严重的感染，如角膜溃疡、眼眶蜂窝炎和内眼炎等应先用药敏实验决定有效的抗生素，然后用药。一般而言，如果用药2～3天后症状不见好转时，就应考虑改用其他药物。虽然眼药是用于眼部，但很多药物会被吸收到全身的循环系统，所以对于肾、肝病患者，应避免使用对肝、肾有害的抗生素。与全身感染用药不同，眼睛感染同时可用多种抗生素的混合制剂。

预防措施：
①保证患处的清洁与卫生，彻底消毒患处；
②适量使用抗菌类滴眼液；
③避免进食辛辣刺激性食物；
抗菌药的眼部用药方法分局部滴药、结膜下、眼内和全身给药等。对于结膜和浅表的感染或眼眶的感染必须全身给药。对于严重的结膜和角膜溃疡可全身和结膜下注射并用。