创伤外科是集骨科、神经外科、危重复合伤救治为特点的专业科室，2013年度被酒泉市卫生局评审为酒泉地区重点学科。核定床位42张，拥有省内一流的洁净层流手术室及西门子C臂机、高清显微镜、骨科牵引床等先进设备。 　　骨科：对各类创伤骨科疾病的诊治积累了丰富的临床经验，特别在开放性骨折和多发骨折处理中经验丰富，新开展了交锁髓内钉固定技术，解决了复杂型、多段管状骨骨折的固定技术难题；积极开展了椎间盘突出摘除术、椎管狭窄症椎管扩大术、胸腰椎骨折钉棒系统内固定术、脊髓减压术、高危颈椎骨折脊髓损伤前路减压椎体成形术、全膝关节置换术及股骨头坏死的全髋关节置换术，高龄患者股骨头、颈段骨折半髋置换术，C型臂透视下成人股骨颈骨折和小儿长骨骨折弹性髓内钉固定的微创治疗。开展了膝关节镜下进行膝关节病变的诊治。近年来已完成多例80岁以上患者的髋关节置换手术及复杂创伤的手术。在CT定位下采取射频消融加三氧技术微创治疗颈椎病、腰椎间盘突出、各类顽固性疼痛疗效显著。应用关节腔灌洗术治疗老年人骨关节炎积累了丰富的临床经验，治疗效果肯定。广泛应用VSD技术对严重骨与软组织缺损、感染、糖尿病足，顽固性溃疡的治疗取得了良好效果。胸腔镜辅助下应用记忆合金环抱器手术治疗连枷胸、多发性肋骨骨折取得了满意的治疗效果。在上级医院专家的指导行完成了我院首例肺癌---一侧全肺叶切除术。 　　神经外科方面开展了颅骨凹陷型骨折复位术、硬膜外血肿、硬膜下血肿、脑内血肿清除术、重型颅脑损伤大骨瓣减压、颅骨缺损三维钛网成型术、脑室穿刺引流、脑室-腹腔分流等手术。采取高压氧，亚低温治疗，中医中药，康复体疗等抢救措施，挽救了大量颅脑损伤患者的生命。针对复合伤患者的严重感染、难治性休克、MOOS、电解质紊乱、营养负代谢等临床疑难问题坚持专科化诊疗原则，极大地提高了严重创伤患者救治成功率和患者的生存质量。

敦煌市医院五官科是集眼科、耳鼻喉科、口腔颌面外科为一体的综合性临床科室。现有医护人员16人，其中副主任医师1人，主治医生1人，住院医师5人，设置床位33张，科室拥有进口手术显微镜、裂隙灯、无散瞳眼底照相机、非接触式眼压测量仪电脑验光仪、耳鼻喉科综合检查治疗台、纯音听阈测定仪、中耳分析仪、电子纤维喉镜、电子耳镜、鼻窦电动手术切削器、鼻窦内窥镜图像显示系统、口腔专业X线摄片机、光固化机、超声波洁牙机、全自动牙科综合治疗机等先进设备。新设备的熟练使用，提高了我科疾病诊疗方面的效率和精确性，尤其是无散瞳眼底照相机的广泛应用，对眼底病变、年龄相关黄斑病变做出精确的诊断。通过眼底检查，对高血压、糖尿病、妊高症、新生儿视网膜病变的分型、分期给出科学、客观的诊断依据。 　　该科开展白内障复明术、青光眼小梁切除术、显微镜下胬肉摘除术、义眼植入术、泪道再造术、鼻中隔偏曲矫正术、鼻甲肥大切除术、鼓膜修补术、微波鼻腔止血术、扁桃体摘除术、鼻腔肿物切除术、先天性唇腭裂修补术、各种颌骨骨折切口复位固定术、各种牙周疾病的手术治疗等。 　　近年来，科室获得酒泉地区科技进步二等奖一项，敦煌市科技进步三等奖一项，现在仍积极应用于临床，服务于患者。

儿科为敦煌地区集临床、科研、教学为一体儿童诊疗中心。多年来承担敦煌地区儿科疑难、危重症的诊治及抢救及下级医院转诊工作。共开放床位36张。拥有多参数监护仪、婴儿培养箱温箱、新生儿红外线辐射抢救台，蓝光治疗箱，无创脉氧监护仪，微量血气分析仪，微量快速血糖分析仪，经皮胆红素测定仪，微量输液泵、婴儿氧舱等先进诊疗仪器及设备。新生儿病区为敦煌地区最早开设的具专科实力的新生儿病区，通过与北京儿童医院、天津总医院儿科建立帮扶与合作，积累了丰富的临床经验，各类新技术的应用，使新生儿重度窒息、肺出血、颅内出血等危重症抢救成功率大大提高， 　　儿科非常重视学科建设，近年来先后有5项课题分别获酒泉地区科技进步奖2、3等奖，发表于国家或省级杂志的学术论文达数十篇以上。全科医务人员以病人为中心，救死扶伤，全心全意无私奉献为宗旨，在本地区享有较高的声誉。