厦门中医院妇科是全市唯一的中西医结合治疗妇科疾病的专业科室。拥有先进的电子腹腔镜、电子宫腔镜、LEEP刀、阴道镜、波姆光及微波（盆腔、阴道、乳腺）治疗仪，负压人流吸引器、笑气和完善的急救设施。技术力量雄厚，拥有主任医师1名，副主任医师6名，主治医师3名、住院医师3名、退休专家3名，其中博士、硕士各1名，在读研究生3名。均有丰富的临床经验。常年开放床位52张，在禾祥东路也设有门诊，常年开诊，中西医结合治疗各类月经病、妊娠病、妇科杂病、产后病及乳腺疾病。开展各类妇科大、中、小手术；开腹、腹腔镜、宫腔镜、阴式及宫腹腔镜联合手术；妇科肿瘤盆腔手术、化疗；无痛人流等各种计划生育手术和宫颈门诊。特色专科：不孕症、月经病、盆腔疼痛症、妊娠病、乳腺病、妇科肿瘤、围绝经期综合征、宫颈疾病、微创手术。

厦门中医院眼科现有医护人员十余名，其中医生八人，眼科博士、主任医师一名，副主任医师两名，眼科学硕士两名，住院医师四名。随着新院建成，眼科在医院的大力支持下，引进人才的同时购进了多台世界先进的医疗设备，如德国Zeiss手术显微镜、德国Humphrey自动视野计（该视野计是目前世界上唯一可长期跟踪分析视野改变的新一代视野计），美国带冷超功能的白内障超声乳化手术仪、美国科医人眼底激光仪，日本佳能电脑验光仪、日本佳能角膜曲率计，日本非接触眼压计，日本荧光眼底造影仪TOPCON 50IX(目前福建省首台)及2100眼科A、B超声仪。在科主任林媛的带领下，已开展了多台白内障超声乳化摘除人工晶体植入术、白内障囊外摘除人工晶体植入术、青光眼复合小梁切除术、眼外伤修补术、球内异物取出术、斜视矫正术（术后不用拆线）、鼻腔泪囊吻合术、泪小管断裂吻合术、翼状胬肉切除联合干细胞结膜瓣移植术、上睑下垂矫正术、双重睑成形术，同时开展了眼底荧光造影及视网膜光凝术，为眼底病当中静脉阻塞以及糖尿病性视网膜病变患者带来治疗的希望。在弱视治疗及中西医结合治疗结膜炎、麦粒肿、干眼症及眼底病方面取得了较好的疗效。尤其在葡萄膜炎、视网膜色素变性、高度近视性视网膜膜病变等眼底病方面有独到之处。

厦门市中医院儿科始建于20世纪50 年代，于2007年获批“厦门市中医重点专科”，2010年获批“福建省中医重点专科”，2012年通过了国家中医药管理局“中医重点专科”评审，2012年获批卫生部国家临床重点专科（中医专业）建设单位。 为北京中医药大学中医儿科学硕士生研究生培养基地，福建中医药大学中医儿科学硕士生研究生培养基地，福建省儿科（西医）医师规范化培训基地 。经过多年的重点专科创建工作的积累与发展，专科规模不断扩大、设备不断完备、人才结构得到优化，西医力量强、中医药诊疗特色优势进一步体现、整体技术实力进一步提高，逐渐建设成为了一个集医疗、科研、教学为一体的综合性科室。 　　人才队伍：科室技术力量雄厚，全科现共有医护人员53人，其中医师系列18名，博士1名，硕士9名，拥有正高级职称医师3名，副高级职称医师3名，中级职称医师8人，初级职称医师4人。 　　业务规模：科室年门、急诊量24万人次，（日均 600～700人次），其中急诊每日24小时开放，日均接诊200人次左右。病区定编住院床位57张，实际开放床位65张，其中新生儿床位25～30张，2012年收治病人3700余人次。专科规模及业务量在全省三甲医院中医系列中位居前列。 　　业务范围：门诊及病区诊疗的病种包括小儿呼吸、消化、神经、肾脏、血液、内分泌、风湿性、心血管、各种感染性疾病及其他儿科常见病多发病等，开展各种小儿危重症抢救，开设新生儿病房及新生儿监护病房（NICU），抢救、治疗各种新生儿疾病疾病，承当厦门岛东部地区儿童医疗重任。门诊开设普通门诊、小儿呼吸哮喘专科门诊，小儿神经专科门诊，内分泌专科门诊等。 　　仪器设备： 科室拥有3台进口小儿高级呼吸机、及CPAP、小儿高压氧舱 、近20台多功能心电监护仪、 除颤仪、 微量血糖计、 经皮胆红素测量仪、 数十台微量输液泵、 空气压缩雾化泵、 近20台新生儿保温培育箱、 光疗箱 ，中药熏蒸仪，脑瘫系列治疗仪等医疗设备。（医院拥有的仪器设备：核磁共振、螺旋CT 、脑电、高级肺功能仪、内镜、各种齐全的生化免疫实验、病理检查等。） 　　科教方面：科室拥有投影仪、单反数码相机、各种专业书籍数十余册，设有专门的示教室，具有良好的教学条件。科室医护人员先后承当了市级、省级、国家级科研课题数十项，发表专业论文百余篇。 　　中医特色治疗的开展：专科将发挥中医药治疗特色优势作为工作的主要方向:开设小儿体质调整门诊;大力开展小儿内病外治疗法，广泛开展各种小儿疾病的穴位贴敷、灌肠、熏洗、推拿、拔罐、三伏三九贴敷疗法，取得了良好的临床疗效；常见优势病种制定了中医诊疗方案以及中医护理常规，开展单病种管理；专科将传统中医儿科“煮散”加以改进，以“袋泡茶”的方式应用于儿科临床 ，临证加减，既保证了疗效，有大大提高了小儿中药治疗的依从性； 并进行理论创新，提出小儿“积常有”状态的理论，并且拟定了“清积疗法”应用于某些小儿常见疾病 的“治未病”治疗，取得了很好的临床疗效。 　　发展目标：科室确立了“中医特色显著，西医保障有力” 新时代新型中医儿科的发展目标，发展中医特色，同时西医诊疗手段跟上时代医学科技发展步划，不断提升专科的综合实力和竞争力，全方位满足群众的实际医疗需要。 　　秉承“愿将人病犹己病，救得他生是我生”的院训，全科上下牢固树立全心全意为患儿服务的崇高思想 “ 一切为了患儿，让患儿健康成长”的理念深入每一位医护人员的心里 专业 耐心 细心服务，专科知名度不断提高，在广大患儿家长中树立起良好的口碑，每日吸引本市及周边县市众多病儿前来就诊， 在福建闽西南乃至东南亚地区享有较高社会声誉。

厦门市中医院骨伤科是福建省中西结合骨关节病重点建设专科、厦门市中西结合骨关节病重点建设专科，开放床位45张，医资力量雄厚，拥有关节镜，C臂机，骨密度测量仪等用于骨科疾病诊断治疗的大型先进设备，专科日门诊量平均约150人次，年收住院1千多人次。专科在近二十年来对髋、膝关节疾患的诊断治疗，积累了大量的临床经验，以中医、中西医结合诊疗优势，取得优良率高于90％的治疗效果，常规开展脊柱、髋关节、膝关节疾患外科手术治疗，在股骨头缺血性坏死、膝关节骨性关节炎中西结合治疗达到国内、省内领先水平，在四肢骨与关节损伤运用手法整复、小夹板固定、丹、膏、丸、散等有自己独特的中西结合治疗体系，在闽南沿海地区和东南亚有一定的影响。本科室承担省市多项研究课题，其中手术加中药治疗股骨头缺血性坏死研究获得省卫生厅科技进步二等奖，中药治疗股骨头缺血性坏死实验研究获厦门市科技进步三等奖。 　　厦门中医院骨二科是以现代医学外科技术为主要治疗手段的临床科室。2003年创立以来得到了发展迅速，在临床、教学、科研诸方面均取得较大的进步，逐步形成了“以创伤为基础、脊柱外科为重点、微创外科为品牌” 　　专业特色学科，并兼顾关节疾病及肿瘤等骨病的治疗，在省内外享有一定的声誉。 　　厦门中医院骨二科现有医护技术人员26名，其中主任医师1名，副主任医师3名，主治医师4名，主管护师2人。近年来先后引进博士1人、硕士3人，形成了较为合理的技术人才梯队。 　　厦门中医院骨二科开放床位44张，门急诊量25000余人次/年；年收治患者1200人次；手术800台/年，大中型手术占50%以上。拥有关节镜、C型臂X光机、等离子刀、CPM关节运动仪等先进的医疗仪器和手术设备。 　　近年来，在学科带头人、科主任李立新博士的带领下，科室上下奋力拼搏、勇于创新，在创伤骨折治疗领域，引进开展了一系列先进技术，如带锁髓内钉治疗四肢长骨骨折，动力髁系统、动力髋系统、GSH钉系统、γ钉系统等，率先在厦门市开展了股骨近端髓内钉技术（PFNa）。紧跟国际、国内的治疗方向与热点，积极开展复杂髋臼骨折、骶骨骨折、骶髂关节脱位等高难度、复杂创伤的手术治疗。目前，骨二科承担了厦门东区大部分骨科创伤的救治任务并被卫生局确定为厦门市创伤救治中心。在脊柱外科领域，骨二科将颈椎病作为主攻方向，在厦门市率先开展了颈椎病等离子刀髓核成型术，取得了满意的疗效。开展的颈椎病前、后路脊髓减压术为广大患者解除了痛苦。率先开展的椎体后凸成型（SKY）术（主要适用于脊柱压缩性骨折）处于厦门市领先水平。对于各种胸、腰椎疾患（脊柱骨折、胸、腰椎管狭窄、腰椎间盘突出症、脊柱不稳、腰椎滑脱等）的诊疗也有独到之处。多种技术与国内三级甲等医院同步进行。在关节外科领域积极开展了国际上先进的人工全膝关节置换术、髋臼翻修手术、以及肿瘤型人工全髋、全膝关节置换手术，使我院关节外科领域跃上一个新的台阶。

厦门中医院口腔科是医院的一个综合口腔医疗科室，成立于1990年，是本市较早成立的一个口腔专业科室。口腔科在各届医院领导的关爱下，经过十余年的发展，已逐渐发展为功能齐全、设备一流、学术地位领先，集口腔医、教、研于一体的临床科室，是厦门市口腔疾病防治的重要部门。年门诊量约两万人次，住院患者几百人次。 　　厦门中医院口腔科在主任于长英主任医师的带领下，已形成了一支技术力量雄厚，具有良好医德医风的医疗队伍，现有医务人员8名，其中主任医师1名、主治医师3名，硕士研究生1名。设有口腔颌面外科病床5张，门诊拥有国内外先进的牙科综合治疗椅8台，并配备进口光固化治疗机、超声波洁牙机、X线牙片摄影机、曲面断层全景机、模型修整机等。 　　门诊时间周一至周日全天开放，24小时急诊。

厦门中医院产科现有床位70张，配有家庭化高级特需病房，拥有一批临床经验丰富的主任医师、副主任医师，2005年分娩数近3400例。 　　厦门中医院产科拥有主要设备名称：法国马丁产床及无影灯，胎心监护仪、超声多普勒、心电监护仪、新生儿复温台、妇科阴道镜、高频电波刀、波姆仪，配备中心给02、传呼系统等先进的诊疗技术设备。

厦门中医院男科是我市首家建立的治疗男子疾病的专业科室，科室本着“关爱每一个男性健康”的办科宗旨，汇集了一批在男科事业的道路上悉心耕耘，有较髙声誉的男科专家与学者，组成了一个为男科事业献身的专业队伍，目前有全国名老中医专家、教授、主任医师，有全国名老中医经验继承人、副主任医师三名，有医学硕士二名，是一支老中青结合，中西医并举的髙素质的医疗专业队伍。 　　医者以悬壶济世、治病救人为天职，我科以精湛的医术、优质的服务、显著的疗效，为广大患者的健康保驾护航，为每个家庭送去温馨和欢乐，深受社会各界的赞誉。 　　视患者为亲人，营造高品位的人文关怀，将患者利益放在首位，充分尊重患者的人格与尊严、尊重患者的个人隐私权与知情同意权。为患者提供最贴心服务。让就诊者明明白白就医，清清楚楚花费。充分体现对患者的尊重、理解和关怀。 　　厦门中医院男科可进行的检查项目有：电脑全自动精液采集、阴茎硬度测定、夜间睡眠阴茎勃起测定、阴茎血流多普勒测定、性激素检测、抗精子抗体检测、精子动静态分析、精液常规分析、前列腺液常规分析、前列腺液细菌培养、支原体培养加药敏、荧光PCR检测支原体、衣原体、淋球菌等、 精索静脉曲张彩超检测、罂粟碱海绵体注射试验、阴茎海绵体造影、睾丸活检等。可开展男科相关的全部检查、化验，检测，以满足临床需要。