全市县级最早成立的专业骨科，是该院以诊治创伤、关节、脊柱、矫形为特色的重点科室。拥有医护人员20人，其中副主任医师3人，主治医师3人，医师4人，其中硕士学位者2人。可熟练开展四肢外伤及骨折、骨关节骨折、脱位，各种手、足踝外伤（包括断肢、指再植）手术，神经、血管、肌肉、肌腱、韧带损伤、臂丛损伤、皮肤及软组织缺损修复、骨盆骨折、脊柱骨折、脊髓损伤等治疗；各种骨关节、韧带、肌腱等慢性劳损、颈（腰）椎间盘突出症及狭窄症、椎体滑脱等治疗；各种脊柱肿瘤、四肢及软组织肿瘤和各种炎症（特异性及非特异性等）治疗；各种畸形矫形及功能重建术、髋（膝）关节置换、人工椎间盘置换术；小儿骨科；骨病及老年轻骨质疏松症等治疗。在全市率先开展腰椎间盘突出症的三氧治疗，以微创为主、不开刀、见效快。

眼科成立于建院之初，拥有副主任医师2名，主治医师2名，医师3名，均在省级以上医院学习多次；拥有国内先进的眼科AB超、视野计、眼底照相机、眼底荧光造影机及眼底激光治疗机，国际最先进的眼科手术显微镜、全自动眼压测量仪。能开展白内障人工晶体植入，抗青光眼手术，上睑下垂手术，斜视手术，泪囊手术，翼状胬肉手术，眶内肿瘤手术，美容以及复杂眼外伤等多种手术。其中小切口白内障手术，干细胞移植治疗翼状胬肉，额肌悬吊治疗上睑下垂，眶内肿瘤摘除等多项手术在该县以及周边地区处于领先地位。常年与北京同仁医院专家合作，开展白内障超声乳化人工晶体植入术，济南眼科医院专家定期来院指导眼底病的激光治疗。

宁津县人民医院中医科为该院特色科室之一，该院为弘扬我国的传统文化振兴中医事业，将中医科建设成为一个整体规范治疗的科室，设有4个诊室：中医诊室、针灸诊室、推拿牵引室、理疗室。 　　中医诊室：张克新主治医师，长期从事中医临床工作，在近30年的临床工作中，通过中医理论辩证论治，对各种顽固性疾病颇有研究，尤其对顽固性头痛、不孕不育症、子宫肌瘤等疾病的治疗效果显著。对胆结石病人的治愈率可达90%以上，深受患者和朋友们的好评及信赖，收到表扬信数封，锦旗数面，2004年被市评为先进个人，曾多次参加省级以上学术会议，在省级以上杂志发表论文数篇。2011年获首届医师节暨优秀医师“道德风尚奖”荣誉表彰。 　　李仲敏，副主任医师，中医科主任，曾多次在省中医院进修学习针灸，中医内科、中医妇科，主要运用中医特色疗法治疗胆囊炎、不孕症、多囊卵巢综合征等疾病及脑血管病的针灸康复治疗，先后多次被单位及科室评为先进工作者。任德州临床全科委员会委员，德州针灸学会委员。 　　针灸诊室：针灸是祖国传统医学，是针灸医学与现代诊疗技术相结合的中医科内设诊室。针灸治疗具有适应症广、疗效明显、经济安全、操作方便的特点。2006年科内开展了微创埋线、浮针、等疗法，主要治疗坐骨神经痛、中风、类中风（口眼歪斜）、头痛、颈肩腰腿痛、失眠、增生性关节炎、末梢神经炎等疾病。其中埋线疗法治疗类中风、肥胖、哮喘疗效显著。浮针疗法对各种疼痛的治疗效果显著。 　　理疗诊室：理疗诊室拥有低、中、高频治疗设备数台，主要有六台治疗仪，经络导平治疗仪，胆囊结石治疗仪。超短波远红外线、电脑中频治疗仪等设备。主要治疗颈肩腰腿痛、肩周炎、伤口感染、颈椎病、腰椎病、脑血管病、末梢神经痛、胆结石等疾病，效果显著。 　　推拿牵引室：苏盛昌，主治医师，从事推拿工作30余年，曾进修于北京东直门医院，对颈椎病，腰椎间盘突出症有独特的治疗方法，自行研制的“仰卧式颈椎牵引器”已获得国家专利，引进了国内先进设备三维电脑多功能腰椎牵引床、腰椎间盘突出症复位器。

口腔科技术力量雄厚、设备齐全，拥有主治医师5名，医师3名。综合治疗椅7台，以及数字化口腔全景机、数字化牙片机、根管治疗仪、洁牙机、光固化机、牙齿美白等整套设备，能开展种植牙、错合畸形的矫治、铸造烤瓷牙修复、规范的根管治疗、牙周病治疗、口腔粘膜病治疗、牙齿美白、窝沟封闭等。科内拥有高压灭菌器、手机清洗机、手机养护注油机、封口机、紫外线等消毒设备，能保证一人一用一灭菌消毒，避免交叉感染。 　　口腔科病房可收治口腔颌面部炎症，外伤、肿瘤的病人，能开展唾液腺肿瘤，面部肿瘤、舌部肿瘤，颌骨囊肿的治疗以及上、下颌骨骨折、颧骨颧弓骨折的手术复位固定，并与山东省口腔医院、济南市口腔医院联合开展种植牙。