重庆医科大学儿童医院康复科成立于1990年，20年来已发展为集神经发育理学治疗、物理运动治疗、日常生活技能训练、心理行为矫治、高压氧、生物电、水疗、蜡疗、药疗和语音训练、支具矫形、SET（悬吊）及感觉统合训练为一体，西南地区最大的儿童残疾预防和治疗综合康复场所。拥有82张病床的康复病房，是全国小儿神经专业组副组长单位，重庆市康复医学会理事长单位，重庆市康复医学会儿童康复专业委员会主任委员单位、中华物理与康复学会重庆分会副主任委员单位，为全国最早的唯一由日本脑瘫治疗专家上田正教授亲自传授并颁发证书认可的上田法治疗中心。
　　康复科现有教授2名，住院医师6名，康复师22名，护士19名，其中7名康复师曾受日本脑瘫治疗专家-上田正教授亲自指导培训。