河北医科大学第三医院肛肠外科是国内三甲综合医院中独立执业最早的专业科室之一，1985年自普通外科分出后独立建组，1990年独立建科，2011年10月肛肠外科又进一步划分为肛肠一科（即肛肠外科）和肛肠二科（便秘科），肛肠外科已走过了20余年的发展历程。1992年河北省中西医结合大肠肛门病专业委员会依托该科而成立，2001年经河北省科技厅、河北省卫生厅批准该科设立为“河北省大肠肛门病研究中心”。
　　肛肠外科现在教授、主任医师2人，副教授、副主任医师4人，主治医师3人，住院医师1人。其中博士3人，在读博士1人，硕士6人。
　　科内现配备有先进的日本Olympus CF-260Ⅰ型电子结肠镜，美国结肠水疗机，荷兰肛肠动力检测仪，多功能肛肠手术电子治疗设备，腹腔镜下结直肠手术设备等。
　　遵照“务实图强、开拓创新”的科训宗旨，经过几代肛肠专科医护人员的不懈努力，该科现已发展成为集临床、科研、教学和预防为一体的肛肠专业化科室，近年来在省内外率先开展了腹腔镜结直肠癌切除术、结直肠癌全系膜切除、结直肠癌联合多脏器切除、直肠癌双吻合器低位保肛术、溃疡性结肠炎全大肠切除回肠J型储袋肛管吻合术、肛门直肠毁损伤的抢救治疗、股薄肌和臀大肌肛门括约肌成形术、直肠脱垂经肛门粘膜切除肌层折叠术、肛周脓肿一期内口切开挂线术、内痔铜离子治疗和PPH手术、直肠前突STARR手术、慢传输性便秘结肠次全切除术、盆底疝修补术、生物反馈治疗便秘等与国际接轨具有高精尖科技水平的多项新技术、新疗法，并在结直肠癌、炎症性肠病、慢传输型便秘等基础研究上取得了长足的进步，获得多项省厅级科技进步奖，发表论文SCI论文3篇，国内论文百余篇，出版专著6部，举办了六届大肠肛门病学习班，与省内外多家兄弟医院建立了长期的学术和临床合作关系，河北医科大学第三医院肛肠外科在省内外肛肠专业领域享有盛誉。