西南医院肿瘤中心是集肿瘤化疗、放疗、生物治疗等为一体的肿瘤专科治疗中心，为博士学位授权学科。医疗主系列人员均有博士以上学历。目前开展床位150张，病房环境优雅，设施齐备，功能完善，达到国内一流水准。
　　肿瘤中心在重庆西南医院率先推行“肿瘤单病种首席专家负责制”和“首选治疗优选制”，从制度和措施上实行了治疗前质控、治疗中检查、治疗后评价的治疗全程监控模式，确保了肿瘤治疗的规范化，彻底避免了目前肿瘤治疗中的普遍存在的随意行为，形成了科学合理的肿瘤临床治疗路径。并根据多年临床实践经验，结合国内外研究进展，制定了一系列肿瘤化疗的优选方案和综合治疗措施，对肺癌、鼻咽癌、乳腺癌、肝癌、食管癌、结直肠癌、胃癌、宫颈癌、卵巢癌、精原细胞瘤、恶性淋巴瘤、头颈部恶性肿瘤等治疗效果突出，显著地延长了病人的生存期，提高了中晚期肿瘤病人的生活质量。
　　病区放疗中心成立于1951年，是西南地区最早开展肿瘤放疗的单位之一，目前拥有国际上最先进的美国瓦里安公司的IGRT影像引导放射治疗系统、高性能医用直线加速器、平板式数字化模拟定位机、放疗专用的西门子CT模拟定位系统、Eclipse治疗计划系统、适形调强验证系统、
　　美国Medtec公司的精确定位系统等全套进口先进设备，开展了肿瘤常规放疗、全身放疗、立体定向放疗(头部、体部X刀治疗)、三维适形放疗、调强放疗及影像导航放疗等先进技术，在肿瘤治疗方面取得了突出的成效，在西南地区乃至全国均具有较高声誉和影响。
肿瘤中心积极开展肿瘤临床及相关基础研究，在肿瘤耐药机制及逆转研究和肿瘤精确放疗方面优势明显，先后获得国家自然科学基金3项，省部级课题11项；获得军队科技进步二等奖3项，军队医疗成果奖2项。病区是国家GCP临床药理基地，每年均开展多项新药的国际、国内多中心临床试验，为肿瘤患者提供最新的临床治疗药物和资讯。
　　肿瘤中心全体人员秉承“以病人为中心，以质量为核心”的宗旨，努力提高医疗护理技术水平，积极推进肿瘤治疗的规范化、科学化和专业化工作，已逐步成为全军及西部地区肿瘤专科人才培训及肿瘤专科治疗重要基地之一。