西南医院康复理疗科成立于1953年，在50余年的发展中取得了长足的进步和发展：
　　·2005年被授予中国人民解放军创伤康复疾病治疗中心。
　　·2005年成为重庆市工伤康复定点(授权)医疗机构。
　　·2003年被授予第三军医大学康复医学专科中心。
　　·2002年被授予重庆市残疾人肢体伤残康复技术指导中心。
　　·1993年成为国内第一个康复理疗学专业博士授权学科。
　　·1986年成为康复理疗学专业硕士授权学科。
　　2000年投资引进世界上最先进的德国奥托博克（Otto Bock）设备并进行技术合作，在全国综合性医院中率先开展假肢矫形器的研制、装配及临床应用。成立假肢矫形器中心（隶属于康复中心），实现了残肢康复、假肢装配和假肢装配后康复训练的一条龙服务。目前科室床位50张，技术人员50余人，学科规模及综合技术力量居西南地区及军内领先，在全国乃至国际物理与康复学界享有较高声誉。
　　康复理疗科每年较好地完成军医大学各层次的康复医学的教学任务以及对全军、全国各地的进修人员进行培养，2003年被医院评为先进教学集体。已培养博士10名，硕士生26名。其中大多数已成为军内各大单位本学科的学术带头人。主编、参编专著20余部，发表论文300余篇，获国家自然科学基金资助3项，获省部级、军队科技成果奖2项。2005年曾荣获第三军医大学集体三等功。
　　中心技术实力雄厚，拥有专业技术人员50余名。其中教授、副教授5人，康复医师13人，康复治疗师22人，假肢制作师4人，临床护士12人。全部康复治疗师都接受过系统、高水平的规范培训，部分人员接受境外研修学习。