北京中医医院针灸中心的前身-针灸科成立于1956年，目前是国家中医药管理局和北京市的针灸学重点学科；卫生部国家临床重点专科和国家中医药管理局针灸重点专科；北京市针灸特色诊疗中心。

　　针灸科自建科之初，汇集了金针王乐亭、管针贺惠吾、三通贺普仁、治痛夏寿人、辨经于书庄、治神周德安等一批在全国针灸界具有较高的声誉和学术地位的针灸名家，是北京地区针灸学科的重要代表。包括金针王乐亭的针具及组方、贺氏三通法理论和火针应用、贺惠吾管针经验、于书庄经络辨证、王居易查经辨证、周德安六治经验等在全国具有影响的针灸学术特色。学科注重学术传承，围绕名医名家组织传承团队；围绕重大疾病及疑难病开展名老中医经验的疗效验证、针刺机理研究及传承推广并探索新名医培养模式。

　　临床上具有突出京城针灸名家特色传承的临床优势和规模。开放床位116张，形成了中风病的急重症治疗、康复治疗和针灸疑难疾病治疗三个不同特色的病区；病区的大中型诊疗设备价值逾百万元，建有NICU重症监护室（拥有功能完善的监护中心站，配备了先进的床旁多参数监护仪、除颤机、呼吸机等急症抢救设备）和康复病区（包括PT/OT康复室、语言训练室）。于2001年率先建立突出针灸特色的“中医卒中单元”，可以开展包括急症监护抢救、针灸中药治疗、早期PT/OT康复、健康宣教等内容的单元规范化治疗。通过不断的提升，目前病床使用率109%，年收治病人数2200余人次，平均住院日16天，开展中医特色疗法41项。针灸门诊拥有治疗床位80张，开展传统针刺、灸法、拔罐和火针、放血等治疗方法；特别是开展了贺氏针灸三通法治疗和王乐亭金针治疗等该专科特色疗法。开设了以疾病治疗为核心的中风、头痛、失眠和下肢静脉曲张等专台门诊和以特色诊疗手段为内容的火针、金针等专台。门诊治疗病种达到400多种，年门诊量15万人次。特色显著、疗效突出，科室连续5年圆满完成医院医疗工作任务书的全部指标，综合评分全院第一。作为国家级重点专科，是全国重点专科协作组组长单位，牵头制定头痛、中风等针灸诊疗规范。

　　学术带头人为国医大师、国家级非物质文化遗产代表性传承人贺普仁教授和国家名老中医周德安教授。学科带头人为中国针灸学会副会长、北京针灸学会会长王麟鹏教授。该学科现有科研、教学人员40人，拥有国家自然基金优秀青年基金项目1人，国家级优秀中医临床人才1人，入选教育部新世纪优秀人才1人，北京市“十百千”卫生人才“十”层次人选1人，北京市中医药人才培养计划（“125计划” ）I类人才3人，国家名老中医学术继承人5人。目前博士生导师2人，硕士生导师4人；博士9人，硕士13人，中级职称以上人员35人。学科建设期间承担国家和省部级课题共20多项，科研总经费3000万元；学科、专科经费获得省部级以上科技奖励7项，获得专利1项，发表学术论文300余篇(SCI收录论文20余篇)。学科开展的针刺治疗偏头痛的临床研究发表了中国大陆学者在国际著名刊物Pain杂志上的第一篇临床研究论文：“Efficacy of acupuncture for migraine prophylaxis: a single blinded, double-dummy, randomized controlled trial”。该论文被Faculty of 1000 medicine(千名医学家机构)所收录，也是中国大陆学者针刺研究进入F1000的第一篇。这对于针灸学及该学科的学术发展具有重大意义。在基础研究方面，以中风病、血管性痴呆、头痛、失眠等常见脑病为研究对象，采用神经行为学、体视学、电生理学、信号转导等角度开展针刺治疗脑病的神经保护机制。学科建立了由神经行为学实验室、神经生理学实验室和临床评价工作室组成的针灸学研究室，积极开展研究工作，获得国家优秀青年基金项目为代表的国家和北京市自然基金等基础研究项目。发表针刺基础研究论文100余篇，SCI论文10余篇。