中医科1956年建科，曾拥有刘耀南、王硕卿等省级名老中医，历任科主任曾华林、陈天翔，现任科主任吴慧忠。走过近60年的风雨历程，经过几代人的共同努力，现有医护人员30名，其中主任医师5名、副主任医师2名、主治医师2名、住院医师1名、主管护师5名、护师3名、护士10名。设有中医科病房1个，床位55张，门诊开设：中医科专家门诊、中西结合消化科门诊、中医妇科，医师均具本科及以上学历，其中硕士研究生学历2名,多数医师在上海、广州等地著名的三级甲等医院系统进修西医专科。能熟练运用中医、西医、中西医结合技能诊断、治疗疾病。护理人员能运用中西结合方法护理病人。
　　建科以来，科室认真贯彻党的中医政策，团结中西医、努力继承发扬祖国医药遗产，突出中医特色，开展中西医结合。对内科常见病、多发病的中医及中西医结合治疗逐步形成了自己的诊疗规范和专科特色，并在医院率先开展多项新技术。在消化系统之消化性溃疡、慢性胃炎、反流性食管炎、食管癌、急慢性胆囊炎、胆石症、肝硬化、炎症性肠病等；泌尿系统之急慢性肾炎、急慢性肾盂肾炎，肾结石；脑血管疾病之脑出血、脑梗塞、血管性头痛；呼吸系统之慢性阻塞性肺疾病，肺部感染；恶性肿瘤化疗之中医配合治疗方面及中西医结合治疗妇科疾病、老年病等方面均获得较好的疗效。对急性肝炎、肾功能衰竭、心功能不全、急性上消化道出血等急症、重症采用中西医结合的治疗方法取得了较好的疗效，突破了中医科只治疗慢性病、轻病的传统习惯，与西医内科对同类疾病的治疗对比显示了中医的治疗风格。由于医疗护理技术水平的不断提高，科室业务量得到大大的拓展，2014年科室年业务量达2400多万，年门诊量近5万人次，收住病人近2200人次，业务收入居全院临床科室第二位，在不断拓展中医及中西医结合临床业务的同时，能做好福建中医药大学、莆田学院、泉州医高专等院校的实习带教任务，2006年被福建中医药大学评为“优秀临床教学科室”，同时做好全县乡村医生规范化培训中医部分的教学任务，科室注重老中医专家学术经验的继承，注重老中医专家的传帮带作用。注意临床经验与心得的总结，历年来发表学术论文40余篇，2014年与福建中医药大学合作课题，荣获2014年福建省科学技术奖三等奖，由于科室的发展，2014年被医院评为“先进科室”，该院2012年被卫生部评为“全国综合医院中医药示范单位”。