骨科分为骨一科、骨二科、骨三科。
　　砀山县人民医院骨一科是该院最早科室之一，具有雄厚的技术力量和优秀的医疗队伍，现有床位40余张，主任医师1人，副主任医师1人，主治医师4人，住院医师3人。科室目前可以开展颈、胸、腰椎各种疾病类手术，全膝、全髋关节置换术，断肢（指）再植等显微外科手术，常规开展骨与关节创伤类疾病及复杂创伤的诊治。
　　砀山县人民医院骨二科现有床位43张，配有关节镜、手术显微镜、C型臂X光机、骨科手术床等先进设备，科室医护人员均在上海瑞金医院、仁济医院，北京解放军总医院（301医院）、安医附院、徐州二院进修学习，专业技术精良。科室目前可以开展单髋及全髋置换术，肢体脱套伤的反取皮回植术，各种髓核摘除术，减压嵌压植骨术，关节置换术；可以治疗复杂骨折如胫骨平台骨折、Pilon骨折、肱骨髁上粉碎骨折等以及多发性骨折，胸腰椎骨折或合并截瘫的前后路减压内固定，各种陈旧性骨折、骨不连、感染性骨不连、创伤后或原发性骨髓炎，各种骨关节炎如骨性关节炎、类风湿性关节炎、强直性脊柱炎、痛风性关节炎、骨关节结核和化脓性关节炎等，儿童常见的先天性畸形如手足多指/趾畸形、先天性斜颈、先天性髋关节脱位等。
　　砀山县人民医院骨三科是砀山县骨科疾病的医疗、科研及教学中心，专业治疗骨折创伤，股骨头坏死，腰椎间盘突出等各种疾患。现有医护人员18人，其中高级职称4人，中级职称5人，是全院专业技术人员最雄厚的科室之一。科室常年开展全髋关节置换，腰椎间盘突出髓核摘除及内固定等多项手术，关节镜微创治疗膝部各种疾患。该院骨科与徐州二院、徐州四院、徐州一院、上海长征医院、上海长海医院、北京积水潭医院等全国知名医院骨科长期开展合作。