福建省肿瘤医院胸外科是福建省肿瘤医院重点科室，在国内首先开展食管癌全胸段食管切除、颈胸腹三野或二野（胸腹）淋巴结清扫手术，已形成一套规范的手术方法，使淋巴结清扫更加彻底，目前已完成3000多例，是国内外开展这项手术例数最多的医院之一。开展胃大部切除术后食管癌切除加结肠代食管手术成功率高。开展了肺癌各类手术切除如全肺、叶及袖状切除术隆突切除重建术等1000多例。2005年引入了胸腔镜微创手术的诊断及治疗手段，开展了纯胸腔镜肺叶切除术。获省科委三等奖1项、省卫生厅二等奖2项。