海门市人民医院妇产科建科已有五十多年，是该市创办最早的妇产科诊疗中心，现为南通市临床重点专科，设有产科、妇科两个病区，共开放床位90张。专科拥有一支医德高尚、医术精湛的优秀人才梯队，医护人员共50余名，拥有高级职称的医学专家近20名，其中多名专家在该地区享有盛名。科室护理队伍拥有较高的技术水平和良好的职业素养，将人性化护理运用至日常工作中，深受病人欢迎。近几年来专科在不断优化的同时，逐渐形成了自身特色，对各种疑难重症的诊治、妇产科疾病的各类合并症、高危病情的处理，均有丰富的临床经验。
　　产科：设有产科病区、产前门诊、产房、产后康复中心，承担着该市及周边地区妇女的孕期保健宣教、产后诊视等工作。在围产保健、优生优育、产前诊断等方面的工作以及妊娠高血压综合征，妊娠合并糖尿病等妊娠合并症及并发症的处理有丰富的临床经验和高超的诊治水平，在治疗产后大出血、产褥感染、新生儿窒息的抢救、早产儿的救治等工作上积累了丰富的实践经验，最大限度地保证母婴健康安全。
产科在南通地区率先开展了无痛分娩技术和家人陪伴分娩（导乐分娩）等特色服务项目，深受产妇好评。经中华医学会儿科医学分会、中华医学会围产医学分会、中华护理协会认证，该科获得了全国首批新生儿抚触、婴儿游泳资质证书。开展的新生儿抚触、新生儿游泳等项目，深受年轻父母的欢迎。创办的孕妇学校，免费为围产期妇女及家属讲授围产期保健及相关知识，深受孕妇们的欢迎，被评为“江苏省示范孕妇学校”。2013年10月成立的“同济大学妇女保健中心产后康复海门分中心”，为海门地区首家专业的产后康复机构，可对因妊娠、分娩后造成的体形改变、生殖器官复旧延缓、盆底功能减退等进行全面康复治疗。
　　妇科：技术力量雄厚，承担着该市及周边地区妇女疾病的诊断、治疗、计划生育、预防保健等工作。对妇科常见病如子宫肿瘤、附件肿瘤、异位妊娠、盆腔炎症、子宫脱垂、尿失禁等疾病有着丰富的诊治经验。在全市最早开展处女膜修补、阴道紧缩及会阴部整形等矫形手术，并率先引进了腹腔镜及宫腔镜等微创设备，成功开展了腹腔镜下子宫肌瘤切除术、卵巢肿瘤切除术等多项微创技术，技术水平位于省内同级医院的前列。专科对妇科恶性肿瘤采取术前介入治疗、盆腔清扫等手术，其治疗方法与国际接轨。近两年开展LEEP刀治疗宫颈糜烂及宫颈息肉等，具有手术精细安全、痛苦小、并发症少等优点；在南通市范围内最先开展无痛人流、无痛上环等技术，深受广大妇女患者的欢迎。2013年10月成立“妇科微创与盆底重建诊疗中心”，为盆底障碍性疾病患者带来了福音。