内蒙古自治区医院中医科现有在职人员十六人，其中主任医师五名、副主任医师七名，主治医师二名，住院医师二名，设有中医治疗室，开展有中医特色的各种治疗，病房设有床位20张 , 使用中西医两种方法治疗各类疾病，并突出中医特色，配合针灸、按摩、药浴治疗各种疾病。
　　主要开展项目：1、运用中医中药治疗内、外、妇、儿、皮肤等各科疾病。2、中医皮肤科：设有专病门诊。3、足疗足浴疗法：科室已开展足浴及足部按摩疗法多年，对多种慢性病有很好的治疗和预防作用。4、针灸按摩疗法：对针灸临床中的常见病有很好的疗效，同时开展针灸减肥疗法及腹针疗法。治疗肥胖症和颈肩腰腿痛疾病。5、手诊检查：通过经络穴位诊查，对疾病作出初步诊断。6、大肠水疗：开展消化道疾病的治疗及肾功能不全患者的排毒治疗。7、中医仪器治疗：科室有五台治疗仪，对颈肩腰腿痛、肝胆、结石症、胃肠、妇科等慢性疾病有很好的疗效。
　　内蒙古自治区医院蒙医科建于1958年，在蒙医药治疗心血管、妇科、消化系统、肾病、风湿、类风湿及骨关节病的诊治方面有独到之处，在肝病及其并发症防治方面很有特色，并设有肝病专科，肝病（病毒性肝病、酒精性肝病、脂肪肝）及其并发症、血脂异常等作为主要研究方向。在抗肝纤维化方面，中蒙西药并用，辨证论治，提高患者的生活质量。在：“蒙药治疗心血管病的药效研究”、“蒙药剂型的改革”、“蒙药美容”、“蒙药中金属元素疗效相关研究”、“蒙药治疗肝纤维化"、“蒙药治疗牛皮癣”等方面取得了重要成果。蒙药制剂室的药剂人员根据临床治疗和科研用药需要、配制加工各类蒙药制剂，为临床提供蒙医药优势，发挥了重要作用。蒙医科先后承担了国家级、自治区级课题近10项，出版了10余部医学专著。目前，蒙医科已形成不同层次的人才梯队，并向培养蒙西医结合硕士研究生方向发展。蒙医治疗室配有多功能治疗仪等设备，以蒙药导电疗法、按摩、针灸等方法治疗风湿病，慢性骨关节病有明显疗效。蒙医药治疗心血管、妇科、消化系统、肾病、风湿、类风湿及骨关节病的诊治方面有独到之处，在肝病及其并发症防治方面很有特色。