骨科是北京清华长庚医院的重点发展科室之一，是按照国际一流水准组建的医疗中心，同时承担清华大学医学院本科生和研究生的教学培养工作。科室分创伤、关节、脊柱和运动医学四个专业方向，以关节和运动医学为重点，以微创、个性化和数字化为发展方向，为患者提供高效、科学的优质服务。科室实行科主任领导下的主诊医师负责制。医生全部毕业于国内一流大学且具有医学博士学位。各专业组主诊医师全部来自国内一流骨科中心如北京积水潭医院、北医三院、解放军总医院等，皆有海外留学经历。科室建设得到解放军总医院（301医院）骨科、台湾林口长庚医院骨科的鼎力支持和帮助。
　　目前骨科拥有手术显微镜、计算机辅助导航系统、关节镜、椎间盘镜、 C型臂X线机、骨科万能手术牵引床、全套骨科手术动力系统及电动、气动高速磨钻等先进的骨科手术设备，可保证完成骨科领域全部高精尖手术。
　　关节专业组由科室负责人潘勇卫主诊医师（来自北京积水潭医院）负责，以关节重建重点，具体包括：
　　1、髋、膝关节骨性关节炎、股骨头坏死、髋臼发育不良，擅长处理复杂条件的关节疾病，如复杂人工关节翻修手术、髋臼发育不良、髋关节严重骨缺损及感染关节的人工关节置换。
　　2、手外科疾病，包括：手部先天畸形、周围神经损伤疾病的手术治疗、手功能重建。
　　运动医学专业组由陈连旭主诊医师（来自北医三院运动医学科）负责，以关节镜下微创治疗各种关节疾患为重点，主要开展：
　　1、以关节镜为主的关节微创治疗：主要包括膝关节前、后交叉韧带解剖单束和双束重建，关节软骨损伤的修复和软骨细胞移植，半月板损伤的治疗和同种异体半月板移植；肩袖损伤和肩关节脱位的微创治疗；踝关节韧带损伤和骨软骨损伤的治疗；各种滑膜炎的手术治疗；髋、肘、腕等关节损伤的治疗。
　　2、髌股关节紊乱的综合治疗。
　　3、运动创伤：包括韧带损伤、肌肉损伤和周围神经损伤等伤病。
　　脊柱专业组开展颈椎病、腰椎间盘突出病、腰椎管狭窄症、胸椎管狭窄症、脊柱骨折脱位、脊柱畸形、脊柱肿痛等，由宋飞主诊医师负责。
　　创伤专业组各类创伤骨折，包括肢体骨折复杂髋臼骨折、复杂骨盆骨折、骨折不愈合、骨折畸形愈合矫正、骨折合并血管神经损伤等，由赵喆主诊医师负责。