儿科建于上世纪六十年代初，当年即被评为市级先进集体。1980年底正式建立新生儿科。集临床、教学、科研、预防为一体，专业小组齐全。该科现有床位45张，年门急诊量4万多人次，住院逾2500人次。
　　医资力量雄厚。该科现有医护员工40余人，其中省医学会儿科分会委员1名，省中西医结合医学会儿科副主任委员1名，市医学会儿科分会副主任委员1名，正、副主任医师、教授10余名，多名医师赴日本、上海、北京等国内外著名院校研修学习。现有硕士研究生5人，在读6人。每年承担南通大学多个医疗专业本科、专科生的理论与临床教学，已为基层医院培养师资30余名。完成两项市级课题，多项课题在进行中。每年发表在省级及国家级杂志的论著20余篇。
　　医疗设备先进。该科拥有国际上最先进的英国SLE高频呼吸机、德国SV—300A呼吸机，新西兰Fisher－Paykel辐射保温抢救台，英国Hill－Rom早产儿培养箱，美国VBFB-2000脑功能生物反馈系统，以及亚低温治疗仪，移动式X光机，婴儿高压氧舱等设备，先进的医疗设备确保了诊断和治疗的硬件品质，危重病抢救成功率高达95%。
　　不断加强专科建设，开设多项专科门诊：儿童哮喘病、矮小症、性早熟、肥胖症、儿童心理障碍、多动症、抽动障碍等专病门诊。成立了南通市儿童癫痫治疗中心、儿童铅中毒防治中心。积极开展新技术在临床实际工作中的应用，其中两项获南通市卫生局新技术引进二等奖、三等奖。
　　常规开展的临床项目有：脑生物反馈系统治疗多动症、高压氧治疗脑损伤、抗癫痫药物血浓度的监测、哮喘过敏原的测定、哮喘吸入疗法、先天性心脏病介入治疗、快速性心律失常的射频消融、脑室内引流治疗脑积水、生长激素的激发试验等新技术。新生儿科开展早产儿的肠道微量喂养，早产儿空肠喂养，超微出生体重儿的综合治疗。新生儿听觉诱发电位的测定，锝99m标记三甲基溴光电子发射CT肝胆造影，磁共振胰胆管造影诊断先天性胆道闭锁，脑干诱发电位诊断胆红素脑病，经外周动静脉换血治疗胆红素脑病。宫内感染的监测，快速血培养诊断败血症。气道灌洗治疗胎粪吸入性肺炎。
　　日常病种除常见病、多发病外，还有较多疑难症。八十年代诊治的疑难症有肝糖元累积症、半乳糖血症、巨细胞包含体病、假肥大型肌营养不良、VitC缺乏病、心内膜弹力纤维增生症、朗格罕细胞组织细胞增生症、中枢性尿崩症、Reye综合征等。九十年代后则亚急性硬化性全脑炎、不完全型川崎病、粘多糖病、组织胞浆菌病、先天性肾病综合征、Turner综合征、Rhe溶血病、低血磷抗VitD佝偻病、VitA过多症、Wilson病、溶血尿毒综合征等。
　　奉行诚信、规范的服务宗旨，追求创新、务实的工作作风。乘风破浪会有时，直挂云帆济沧海。儿科人决心为祖国下一代的健康事业不断地努力。