昌吉州人民医院眼科成立于1979年，1985年和北京同仁医院合作，由同仁医院眼科专家在科室协作指导工作，科室分期分批派人去同仁医院眼科进修学习。1990年被自治区卫生厅三康办定为新疆首批白内障复明定点医院。1992年和上海医科大学进行技术协作，积极引进开发新技术，1995年被批准为昌吉州眼病防治中心。昌吉州人民医院本着“世界在您的眼中，您的眼睛在我的心中”的服务理念，全心全意为患者服务。
　　昌吉州人民医院眼科年门诊量18000人次，住院部设病床30张，有医护人员19名，主任医师2名、副主任医师3名、主治医师1名，副主任验光技师1名，副主任护师2名、主管护师4名，护师3名，形成了一支技术力量较强的业务骨干队伍。
　　昌吉州人民医院眼科开展各类白内障手术，各类青光眼手术、视网膜脱离手术、眼底病激光治疗、泪道激光手术、各种眼外伤、近视手术、斜视矫正、上睑下垂、双重睑及各种眼部整形手术及眼显微外科手术，85％的技术达三甲医院水平，曾获国家专利一项，在国内多家核心期刊发表论文多篇，在同级医院中享有较高声誉。
　　昌吉州人民医院眼科现拥有进口超声乳化仪，全疆唯一的青光眼早期诊断仪，博士伦超声乳化仪、日本TOPON眼底照相仪及半导体激光、YAG激光、泪道激光治疗仪及眼电生理仪、德国海德堡视网膜断层扫描仪（HRT）、超声角膜测厚仪、眼科A超、全自动电脑视野仪、同视机等多种先进的医疗设备，全方位满足患者的需要。