是医院的重要临床科室，由消化、血液、内分泌、肾内，神内等专业组组成。现有医护专业人员40人，其中高级职称6人，中级职称7人。科室目莆开放床位4 0张。每年收治病人近1300人，血液科方面：
　　可以开展各类血液病，辩巴癌和免疫性疾病的诊断和治疗。
　　消化科方面：擅长消化内镜诊断和消化性溃疡、上下消化道大出血昀诊诒、功能性胃肠疾病、慢性便秘、重症胰腺炎、慢性乙肝，肝炎后肝硬化、酒精性肝病、脂肪肝的诊诒。在胃食管反流病、消化性溃疡、功能性消化不良、肠易激综合症、胃肠道肿瘤的诊断和诒疗上积累了较为丰富的经验。洪砌主任从医30年，擅长中西医结合诊断、诒疗本专业构常见病、疑难病及临床教研工作，精于消化内镜诊、治构综合应月。在胃肠道疾病、肝胆胰疾病构诊治方面有专长。
　　内分泌科方面：内分泌纽不仅对耱尿病、甲亢等常见癔和多发病沟诊治有一定水平，对肾上艨，垂体，性腺痰病、艇弊症，骨质琉松症、更年期综合症、病风、甲姨腺功能减退症等疾病的诊治也有较喷显的伉势。畿动态监测血耱，精确掌握血糖窳商、病情复杂患者的血耱情况，结合血耱监测及胰岛素泵购强他治疗，可使住院糖尿病患者血糖血髓血匿等指标控制达标率踢显提高，住院时阐明显缩短。
　　肾内科方面：擅长对原发性和继发肾小球疾病、肾小管疾病、I gA肾病、肾病综．合症、慢性肾功能衰竭的诊断及治疗，病区内拥有血透室，血液净化设备4台，能独立开展动静脉_内褰成形术、腹透管插植术、王Cu床边血液净化抢救技术。
　　神经内科方面：对脑出血、脑梗塞，周围神经性疾病昀诊断和治疗有独到妁经验。
　　内三科是南安市综合性医院中唯一的感染性疾病专业性科室。经过30多年的发展，科室已成为市医院内科系统中技术力量较为雄厚、技术设备齐全、开展新技术、新操作较成功的科室。2006年被泉州市团委评为“泉州市新长征突击队”。病房有单间及三人间，均有独立的卫生间、浴室。设有肝、肺、肠道、发热门诊。科室由一名副主任医师，两名主治医师，六名医师及十几名护士组成。科室现有纤维支气管镜、床边X光机、心电监护仪、呼吸机等设备。能开展纤支镜检查、胸膜活检、胸腔闭式引流、经皮肺穿刺术、肝穿刺术、心包穿刺术等。对急慢性肝炎、肺结核、肺癌等的诊断、治疗及对呼衰、心衰、大咯血、上消化道大出血、重症肝炎等危重病抢救具有丰富经验。