上海东方医院中医科是上海市综合性医院“示范中医科”及上海市中医脂肪肝特色专科建设单位。中医科内设有中医内科、中医伤科、中医外科（包括痔科）、针灸科、推拿科、中医脂肪肝专科等六个二级科室，共有24名医师，其中副主任医师5人，主治医师10人，住院医师9人。科室内博士1名，硕士3名，本科11名，大专9名，有较合理的梯队结构。
　　上海东方医院中医科各二级科室均有自己的优势特色，对心脑血管病、脂肪肝、脾胃病、肾病、哮喘、妇科病、男性病等疗效显著，吸引了大批的患者。对腰椎间盘突出症、强直性脊柱炎、骨关节炎、各种腰腿痛运用中西医结合、针灸、推拿手法治疗取得了较满意的效果。
　　中医科拥有以下特色专科：
　　1、上海市中医脂肪肝特色专科：采用院内纯中药制剂——东方肝康口服液治疗，每年平均治疗脂肪肝患者27000人次，已应用16年，临床疗效安全可靠，取得了简易、实用、较准确的效果。承担了多项市科委、市卫生局课题。
　　2、浦东新区中医脑血管病优势领先专科：负责人张春燕博士，主任医师，现任同济大学附属东方医院中医科主任，同济大学副教授，硕导。该专科共有8名医师。其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师5人；博士2名，硕士1名，本科5名。病区采用中医综合疗法治疗脑血管病，运用中药、针灸等多种手段，指导患者实施正确的康复锻炼，取得了较好的临床疗效。该专科承担区局级课题3项。
　　3、浦东新区中医冠心病特色专科：该专科于2008年立项，学科带头人张春燕博士，主任医师。该专科共有8名医师。其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师5人；博士2名，硕士1名，本科5名。
　　对于冠心病的治疗重点从三方面入手：（1）冠心病介入、搭桥术后中医药治疗：在辨证论治的基础上，加用益气活血、宁心安神的药物，明显改善了术后患者的健康状况，减少了冠心病的复发。（2）冠心病伴有早搏者：若心率快而伴有早搏者，以益气活血、养阴宁心为主，能够逐渐减少西药抗心律失常的用量而至停用。继续用中医药治疗，早搏无反复现象。若心率缓慢而伴有早搏者，以温阳益气，养阴复脉为主，方用炙甘草汤合麻黄附子细辛汤加减，能够提高心率，减少早搏次数。（3）窦性心动过缓：以温补心肾，通阳益气活血为主，能逐渐提高心率，改善心肌供血状况，深受病家的信赖。