呼吸内科（原肺科）创办于1952年，后不断开拓创新、发展壮大，为安徽医科大学最早的硕士学位授予点，现为博士学位授予点和全国临床医学重点建设专科。呼吸内科现共有3个病区、1个肺功能室、1个内窥镜室、1个睡眠呼吸监测室和260 m2实验室组成。科室现有各级医生19人：正高职称10人、副高职称7人、博士生导师3人，硕士生导师6人。许学受教授编著的《肺科手册》再版四次，发行量近5万册，另外研制的《XFY-A及XFY-B型多功能胸腹诊治仪》和《微型气胸自动诊疗仪》获得省科技进步二等奖及国家实用新型专利。近年来共获得9项国家自然科学基金、中央补助安徽省公共卫生专项资金1项、卫生公益性行业科技专项项目1项及20余项省厅级科研课题，每年发表论文30余篇，其中SCI论文5-7篇、中华系列论文10余篇。
　　全科目前共设床位95张，常备多导监护仪15部，能够监测所有（无创）生命指标；配备德国肺功能检测仪、日本电子纤维支气管镜、超声支气管镜、胸腔镜、各种型号无创和有创呼吸机、氩气刀、冷冻仪以及血气分析仪等，具备良好的抢救危重症条件，已开展经纤维支气管镜气道内介入治疗（气道良恶性肿瘤）、胸腔镜检查（不明原因胸腔积液）、支气管激发试验（咳嗽变异性哮喘）、支气管内超声检查（气管、支气管粘膜下病灶）、气管镜下介入治疗（气道肿瘤）、睡眠呼吸监测和压力滴定技术（鼾症）。