福建省立医院基本外科续源于原省立医院普外科，成立于1937年，作为外科最基本的科室，普外科亦同时成立；随着医院的发展壮大，于2006年搬入新综合大楼，在普外科基础上成立了福建省立基本外科，实际为普外科的延续。国内如“北京协和医院”等大型综合医院均以此命名。省立医院基本外科现为医院的一级科室，经过几代人的努力发展建设，现已成为集医疗、科研和教学为一体的现代化科室。系省科技厅优先发展学科，省卫生厅医学重点专科，现有主任医师2名，副主任医师3名，医师4名，6人具有硕士、博士学位。每年接受福建医科大学等高校见习、实习医师以及全省各地的进修医师数十名。科室年门诊量大于10000人次，现开放47张床位，年收治病人数超过1200人次，每年开展各类手术包括微创手术800余台。科室技术力量雄厚，医疗设备齐全。特别在内分泌肿瘤(甲状腺肿瘤、甲状旁腺肿瘤、胰岛细胞瘤等)，乳腺疾病，门脉高压症，胰腺炎和胰腺癌，腹壁疝等疾病的治疗方面均达到国内先进水平，居省内领先地位。
　　基本外科亦称普通外科，具体专业范围包括：
　　1.颈部疾病：主要是甲状腺和甲状旁腺疾病，如甲亢、巨大结节性甲状腺肿大、甲状腺癌和甲状旁腺瘤等。甲状腺肿瘤的治疗及手术操作技术经过系列改进达到规范；广泛开展了腔镜甲状腺结节切除及甲状腺癌的功能性颈淋巴结清扫术，在获得最佳疗效的同时兼顾了美容效果。开展甲状旁腺肿瘤力的定性定位诊断及早期手术治疗。目前已逐步成为省内甲状腺疾病，特别是疑难、复杂甲状腺疾病的会诊治疗中心。
　　2.乳腺疾病：各类乳腺良恶性疾病，如乳腺癌、乳腺增生、乳腺炎等。科室引进了世界上最先进的钼靶摄影机行乳腺摄片，并结合乳腺摄片行选择性乳管造影对乳头溢液进行定性定位诊断；对乳内可疑病变行计算机立体定位、高精确度穿刺活检以对乳腺疾病早期诊断；开展早期乳腺癌的保乳术及乳癌综合治疗；对中晚期乳癌广泛开展以改良根治术为主，新辅助化疗、术后化疗、内分泌及靶向治疗、中医辅助等全新综合治疗，获得良好效果。对良性乳腺疾病的手术切口采用美容技术，切口疤痕小，外观美容。
　　3.肝硬化门脉高压症：根据具体病因及患者的血流动力学改变选择断流和/或分流手术，术后病人的近、远期的门脉血流动力学稳定，并最大限度的保护肝功能，取得良好疗效。
　　4.胰腺疾病：各类胰腺肿瘤（如胰腺癌和胰岛细胞瘤）及急慢性胰腺炎、胰腺囊肿等。采用个体化方按治疗急慢性胰腺炎，使重症胰腺炎患者死亡率显著降低，部分极高危病人救治成功，已形成一套完整的诊疗体系。胰腺肿瘤新胰十二指肠切除，手术切除率及术后生存率均达到省内先进水平。
　　5.疝及腹壁疾病：各类腹外疝、腹壁肿瘤、腹膜及腹膜后肿瘤等。在省内最早开展人造网片填充式无张力疝修补术。对各种复杂疝、复发疝根据具体病情选择不同的材料和修补方法，术后患者基本无传统术式所出现的不适症状，恢复快、复发率低。处国内先进水平。
　　6.其它腹部外科疾病：各种急腹症如肠梗阻、上消化道出血、阑尾炎、消化性溃疡急性穿孔等，以及胃、结肠、直肠良恶性肿瘤；肠瘘的治疗，短肠综合征，脾脏外伤、肿瘤、脾脏功能亢进症。
　　7.血管性疾病：周围血管损伤、下肢大隐静脉曲张等。
　　8.皮肤小肿瘤和炎症：如脂肪瘤、粉瘤、丹毒、蜂窝织炎、淋巴管炎等。