福建省立医院消化内科专业系我省和卫生厅的医学优先发展重点学科，1997年由省政府批准成立福建省胃肠病研究所，1998年被卫生部批准为临床药理基地，是福建医科大学硕士研究生培养点。由消化研究室、消化内镜室、胃肠运动功能室、消化内科病房和门诊组成，承担医疗、教学、科研等任务。
　　福建省立医院消化内科现有专业人员23名，其中高级职称10名，中级职称9名，7名具有硕士、博士学位。有教授1名，副教授4名，硕士研究生导师6名，另有2名退休主任医师参加门诊。发表论文250余篇，获省科技进步奖或省医药卫生科技进步奖21项。学科拥有国内外先进医疗、科研设备，包括电子胃镜、电子肠镜、超声胃镜、消化道压力测定仪、24小时动态胃食管pH监测仪、24小时动态胆汁反流监测仪、胃肠激素测定、分子生物学、多聚酶链反应（PCR）、高效液相色谱分析、肠道菌群分析、腹水浓缩回输等。在消化内镜诊断治疗、幽门螺杆菌发病机制研究、胃肠动力障碍性疾病诊治以及急性重症胰腺炎、肝脓疡、肝硬化等消化系疾病的诊治达国内先进水平，居省内领先地位。其中专家任全国消化学会委员、全国消化内镜学会委员、福建省消化学会主任委员，全国消化学会幽门螺杆菌学组、动力学组和激素学组三个委员，为中华消化杂志、中华消化内镜杂志、世界华人消化杂志、胃肠病学和肝病学杂志等多种杂志编委。专业的全体人员愿竭诚为广大病患者提供精湛的医疗技术和热忱的医疗服务。