内蒙古妇幼保健院儿童保健科承担着我区集体儿童管理、散居儿童保健、儿童生长发育监测、儿童心理卫生保健与咨询、儿童营养卫生与咨询、儿童眼保健、儿童听力保健及儿童常见病与多发病的预防与治疗。同时承担着妇幼卫生合作项目中儿童保健方面的基层监督指导及培训。
　　现有正主任医师3人，副主任医师3人，主管医师2人，医师/检验师3人，见习医师3人，幼师1人，检验士1人，护士1人。下设二级亚科室：儿保专家门诊、儿保专家优质服务门诊、儿童心理卫生门诊、儿童营养门诊、儿童生长发育监测门诊、儿童听力保健门诊、儿童系统管理、儿童体检、儿童铅中毒防治、儿童早期发展等门诊，对儿童贫血、佝偻病、微量元素缺乏、维生素A缺乏、碘缺乏等营养性疾病进行诊治，并开展儿童铅中毒防治及0—3岁儿童早期发展的宣教与指导，对儿童多动、抽动、情绪障碍、孤独症、儿童感觉统合失调、学习困难、注意力缺陷等诊断、咨询、指导与针对性训练。
　　拥有实力较强的儿童营养实验室，现有日本日立原装F—2500型荧光分光光度计、BH—5100型原子吸收光谱仪、BH—2100型钨舟原子吸收光谱仪、紫外分光光度计等，对儿童常见营养缺乏病及铅中毒提供可靠的实验室诊断。