吉林大学中日联谊医院病理科创建于1961年，是省内最大的临床病理诊断中心之一。分总院及二部（新民大街）两处，科室面积达900余平方米，设有标本接收室、标本检查室、组织技术室、冰冻切片室、免疫技术室、原位杂交室；常规诊断室、冰冻诊断室、疑难病例会诊室；穿刺细胞检查室、常规细胞技术室、常规细胞报告室；学术活动室、研究生、进修生教室及病理档案室等。现有工作人员17人：医生9人（教授/主任医师2人，副主任医师4人，主治医师1人，住院医师2人）；技术组8人（主任技师1人，主管技师5人，技师2人）。具有博士后学位1人，博士学位3人，硕士学位6人。5名医生和技术人员先后8次被院、校和国家教育部选送到日本、加拿大和美国接受专业训练并参加科研工作。科内配有日本奥林巴斯各型显微镜19台，其中十人共览显微镜1台、五人共览显微镜1台、三人共览显微镜4台，此外还有先进的德国美康全封闭组织处理机、冰冻切片机、全自动染色机和封片机等。
　　吉林大学中日联谊医院病理科承担的常规工作包括中日联谊医院总部、二部和三部的活检、术中急检及省内、外的会诊，每年病例2.0万余人次；作为我校临床学院第一个培养病理学研究生的科室，现有导师3人，自1999年始招收全国统招和在职研究生17人，已毕业研究生在美国、英国、国内京、津、沪各大医院从事专业工作或继续攻读博士学位。科室还承担着进修生的培养任务，每年接收5-8人，为省内、外输送200余名病理专业人才。在科研工作中，曾独立承担卫生部、教育部课题，并参加国家自然科学基金及省、市的合作项目，在十几种中、外专业杂志上发表论文百余篇，参译、参编及主编出版的专业书籍和“十一五”规划教材十余部，多次获得省级医疗成果奖和科技进步奖。
　　吉林大学中日联谊医院病理科近年来应用免疫组化技术提高了诊断水平。除了常规乳腺癌雌、孕激素受体和相关肿瘤基因的检测外，陆续开展了淋巴造血肿瘤的免疫表型分类、肿瘤多药、耐药基因检测、脑垂体肿瘤、肺小细胞肿瘤的功能分类、女性生殖道人乳头瘤病毒感染以及前列腺癌激素受体和预后相关基因的检测等新项目，为肿瘤的个性化治疗及预后因素的探讨提供了客观的依据。尤其是在穿刺细胞学和组织活检中，在常规技术质量和免疫组化标记的保证下，肿瘤的早期诊断在省内保持领先地位，得到专业内、外的认可，成为2004年秋建立吉林省乳腺疾病研究所的支柱学科。
　　吉林大学中日联谊医院病理科在四任科主任的带领下，走过了48年的历程。近年来，学科建设迈上了一个新的台阶，专业技术趋向成熟。本着“对病人负责，就是对自己负责，对社会负责”的态度和不断进取的精神，脚踏实地，一丝不苟的为病人服务，为医院把好术前（治疗前）、术中（治疗中）和术后（治疗后）诊断的“三关”，让医院放心，让患者满意。