吉林大学第二医院病理科始建于1961年，历经50余年，在医院领导的大力支持下，在兄弟科室的帮助下，经几代病理人的共同努力和奋斗，现已发展为集临床病理活检诊断、细胞学诊断、分子病理学检查、研究生培养、医师培训以及科研为一体的综合性科室，在吉林省病理界发挥着学术带头作用。病理科在妇产科疾病，前列腺疾病及普通外科疾病的病理诊断处于省内及国内领先水平。目前科室还承担多项国家级、省部级科研项目，并获得多项科技成果和医疗成果，发表多篇SCI收录论文，在省内及国内有较高的学术地位和影响力。
　　全国病理重点专科项目评选，是由国家卫生部、财政部组织，通过科室实力展示和专家评审，在中华医学会评估基础上，经国家临床重点专科建设项目管理委员会审定的重要活动。我院病理科于2011年9月被确定为2011年度国家临床重点专科建设项目，这是我院病理科发展史上的一座里程碑，更是我院综合实力强有力的展现。
　　病理科现有工作人员29人：教授1名，副教授3名，主治医师2名，住院医师7名；副主任技师1名，主管技师4名，技师5名；其他工作人员包括资料员等5人。博士生导师1名，硕士生导师2名，具有博士学位的有5名，在读博士4名。其中医生14人，医生队伍中绝大多数人员具有博士学位，并有出国留学经历，骨干力量全部为中青年医师，有很大的发展潜力。现病理科主任高洪文教授是目前省内医院病理科室中唯一的博士生导师，吉林省有突出贡献的中青年技术人才，全国卫生系统先进个人，吉林省医师协会病理科医师分会主任委员，我省临床病理的学术带头人。通过和国内外病理专家的不断交流与合作，推动了吉林省临床病理诊断水平的提高。
　　病理科设备先进，国内一流。科室目前拥有当今最先进的病理设备，为提高病理质量提供了保障。科室有Leica IP C全自动包埋盒打号机、Leica IP S全自动载玻片打号机、Leica1950全自动恒冷切片机、ThermoFisher Excelsior ES全封闭自动脱水机、Leica2145/2155半自动及全自动石蜡切片机、ThermoFisher EC350石蜡包埋机、LeicaST5020/Cv5030多功能全自动染片盖片工作站、Dako Autostainer Link48全自动免疫组化仪、Milestone MacroPath D大体数字病理摄影系统、DP26 Olympus病理显微图像采集系统、Olympus BX51-32FL荧光显微镜、Olympus BX51-MD0-10十人共览显微镜、Olympus BH2五人共览显微镜、Olympus BX51-MD0-2二人共览显微镜、Ventana Bench Mark XT全自动免疫及原位杂交仪、Olympus Fish杂交分析系统、Ventana罗氏数字病理系统、RocheThe cobas 4800II荧光定量PCR仪，CBG Biottach二甲苯回收仪，格林蓝德病理网络工作站。
　　科室工作分工明确，工作流程规范化，标准化。建立了规范的病理工作流程，明确分工与责任，保证病理质量。如门诊小标本的取材，包埋、切片、染色及制片的规范化操作及工作流程；胃癌及结直肠癌标本固定、淋巴结分组取材及诊断规范化操作流程；子宫等妇产科标本的取材流程；乳腺癌免疫组化检测及分子分型报告流程；肺癌的EGFR基因检测规范和流程等；在全省乃至省外的病理同行中起到了很好的示范和指导作用。在国内率先开展了病理标本大体照相和数码显微镜下摄影及病理网络化管理，推动了国内大医院病理科大体取材工作流程的规范化，逐步和国外病理工作流程接轨。
　　科室重视加强国内外合作与交流，已和国内外多位病理专家建立了广泛的联系和合作，每年均邀请多名国内外病理专家到科室进行学术交流与工作指导 。近5年来，每年均邀请加拿大曼尼托巴大学的William Orr教授到我科进行为期3个月的工作指导及病理会诊，这使科室的很多工作不断完善，也促进了年轻医生学习英语的积极性，提高了年轻医生的英语水平。同时在病理诊断水平特别是在骨关节及肝脏病理诊断方面有很大的提高，使年轻医师的病理诊断思维模式更加科学。我科还与日本的多所大学、医疗单位建立了良好的合作关系，每年均有日本学者来我科指导工作，如日本东北大学的一迫玲教授，川崎医科大学的森谷卓也教授，国立仙台病院的手冢文明、铃木博儀教授，宫城县癌中心的佐藤郁郎教授等。与国内多家知名医院的病理科建立了长期合作关系，如：北京友谊医院病理科，北京大学肿瘤医院病理科等，上海复旦大学肿瘤医院病理科等。通过与国内外的专科合作，促进了我省病理整体水平的提高，促进了我省病理事业的发展。科室重视医生培养，有计划安排医生到国外进修学习。如夏阳医生在日本国立仙台病院进行为期半年的学习，并侧重在神经系统肿瘤方面；姚敏医生在日本东北大学病院，进行淋巴瘤方面的学习等；这种交流与培养方式提高了我院病理科整体诊断水平，优化了科室梯队，突出了科室的诊断特色，加强了国内外的学术交流与合作。去年6月份，数字病理扫描系统及远程病理会诊系统正式启用，在国内率先建立了目前当今世界最先进的远程数字病理会诊系统。通过传统的病理切片转化为高质量的数字切片，借助现代互联网络技术的支持，实现了疑难病理在国内外不同病理专家间同步观察与诊断，给疑难病患者提供了快速的准确的病理诊断信息，为病人的治疗提供了保障。同时也实现了病理同行间资源共享，加速了病理诊断的国际化进程。
自建院以来已完成病理活检诊断近45万例，居省内之首。2012年完成3.7万余例活检病理诊断及2万余例细胞学检查，省内外疑难病理会诊2千余例，在吉林省发挥着病理会诊中心的作用。
　　常规开展特殊染色，免疫组织化学染色、原位杂交、分子病理检查、液基薄层细胞学技术、细针穿刺细胞学诊断等技术。在省内创先开展了乳腺HER-2的基因检测，为乳腺癌患者的靶向治疗提供依据。分子病理检查项目是科室目前重点建设内容，各种恶性肿瘤如肺癌、结直肠癌等的突变基因检测对指导患者的治疗至关重要，我们将逐步全面开展肿瘤的基因检测。
　　病理科将以国家临床重点专科建设项目的支持为新的契机和起点，进一步完善硬件与软件建设，加大人才培养力度，引进医疗先进技术，以更高的标准和目标要求，逐步把我科建设成为在全国有重要影响的病理诊断中心，更好地为广大患者提供优质服务。
　　
　　科室主要服务项目：
　　1、常规病理活检检查与诊断：是病理科最常用检查手段。送检病理标本需要用10%中性福尔马林进行固定，由诊断医师进行取材，由病理技术员进行包埋，切片染色等程序制成病理切片，最后由诊断医师进行阅片签发病理报告，通常病理标本送至病理科到签发报告单需4-5个工作日。对于疑难病例及特殊病例需科主任及科室诊断医师共同会诊后作出最后病理诊断。
　　2、手术中快速活体组织病理检查与诊断：通常病理医师在40分钟内完成诊断。
　　适用范围： 需要确定病变性质（如肿瘤或非肿瘤／良性肿瘤或恶性肿瘤等），以决定手术方案的标本。了解恶性肿瘤的扩散情况，包括肿瘤是否浸润相邻组织、有无区域淋巴结转移等。确定肿瘤部位的手术切缘有无肿瘤组织残留。确认切除的组织，例如甲状旁腺、输卵管、输精管及异位组织等。
　　不适用范围：疑为恶性淋巴瘤、过小的标本（检材长径≤0.2cm者）、术前易于进行常规活检者、脂肪组织、骨组织和钙化组织、需要依据核分裂象计数判断良、恶性的软组织肿瘤、主要根据肿瘤生物学行为特征而不能依据组织形态判断良、恶性的肿瘤、已知具有传染性的标本（例如结核病、病毒性肝炎、艾滋病等）。
　　3、细胞病理学检查与诊断： 检查结果在送检第二个工作日完成。
（1）妇科宫颈脱落细胞学的检查：我院病理科细胞室是吉林省最早开展宫颈液基细胞学常规检查的科室之一，妇女宫颈癌筛查的一项先进的技术，可早期发现宫颈癌及癌前病变。（2）非妇科细胞学检查包括脑脊液、甲状腺穿刺液、乳腺溢液、痰液、肺泡灌洗液、胸水、腹水，腹腔冲洗液，卵巢囊肿穿刺液、尿液、淋巴结穿刺液、关节液等细胞学检查。（3）细针穿刺细胞学检查与诊断：主要包括各种体表肿物(淋巴结、乳腺。甲状腺等部位)细针吸取细胞学检查。（4）下级医院细胞学诊断和会诊。
　　4、免疫组织化学染色：已开展100余种免疫组化染色，如：ER、PR、HER-2、Ki67、TTF-1、CD3等。染色方法采用全自动免疫组化染色仪进行染色。通过借助免疫组织化学染色手段，提高病理诊断的准确性，指导临床治疗，对肿瘤的预后及细胞增生程度进行评价，辅助肿瘤分类、分期、分级，确定组织来源、判断肿瘤原发部位，免疫性疾病的辅助诊断等，活检组织和胸水、腹水等标本离心沉淀细胞块，均可进行免疫组织化学染色。
　　5、特殊染色:目前开展胶原纤维染色（Masson等）、网状纤维染色、弹力纤维染色、糖原染色（PAS）、抗酸染色、六胺银染色，刚果红染色方法。对于一些感染性疾病如结核、麻风、真菌感染等感染性疾病和一些肿瘤性疾病有特殊的诊断价值。
　　6、分子病理学检查：开展了乳腺癌HER-2基因FISH检测，肺癌EGFR的基因检测，肺癌ALK基因检测，对肿瘤的分子靶向治疗提供依据；开展了EBER检查，为病理诊断提供依据。1周内完成报告。
　　7、对外疑难病理会诊：外单位疑难病理由科室集体会诊做出诊断意见，供原单位病理医生参考。通常在送检2小时后取报告。