南昌大学第一附属医院1982年开始成立内科呼吸治疗组，1985年正式成立独立的呼吸内科。自成立以来，科室不断开拓进取、发展壮大，目前该科室是江西省唯一一家拥有卫生部国家内镜培训基地、 江西省呼吸疾病研究所、江西省重点实验室、GINA 全国培训中心、中华医学会江西省呼吸病分会主任委员的单位。2012年科室成功入选“国家临床重点专科”，目前全科拥有专业技术人员58人，其中医师团队18人，护士团队37人，医技人员3人。医师团队中，享受国务院特殊津贴1人，省卫生系统高层次学术技术带头人3人，正高5人，副高6人，中级2人，拥有博士学位3人，硕士学位13人，现有硕导5人，博士生导师2名；已培养博士、硕士研究生50余名；护士团队中拥有高级职称1人，中级职称5人，初级职称31人，30人具有学士学位。
　　呼吸科现有病床100张，年出院人次3600余人次，年门诊62000余人次，每年支气管镜检3000余人次，肺肿块穿刺活检600余人次。配有呼吸重症监护室、肺功能/血气室、呼吸内镜室、睡眠监测治疗室、呼吸科实验室。2011年呼吸科实验室升格成为江西省呼吸疾病研究所，为省级重点实验室，可以开展多种检测如呼吸道非典型病原体感染检测等。
教学方面，呼吸内科1998年批准为硕士点，2006年取的内科学博士点资格，现有硕导3人；博士生导师1名；已培养博士、硕士研究生30余名；每年肩负学院本科生/成教的呼吸内科及诊断学教学工作，每年接收专科进修生10余名；先后承担国家科技支撑项目1项，国家自然科学基金2项，省厅级课题20余项，获卫生厅新技术创新奖1项 ；通过省级成果鉴定2项 ；国家级发明专利1项；近五年来国内期刊发表论文100余篇。近3年分别举办了全国继续教育 “肺部阴影鉴别诊断学习班”2次、江西省呼吸疾病新进展学习班1次，主持完成“十一五”国家科技支撑计划课题1项，国家自然基金1项，省厅级课题几十项，在省内率先建立“江西省慢性阻塞性气道疾病信息化管理系统”，实现慢性病的信息化管理。与此同时，科室大力加强亚专科建设，形成了肺部感染性疾病、呼吸危重症、气道疾病与睡眠、肺癌、间质性肺疾病、呼吸介入、肺栓塞与肺血管病、肺部疑难少见病等亚专科。
　　主要仪器和设备，日本Olympus 电子支气管镜3台；德国耶格肺功能仪1台，血气分析仪2台；进口便携式多导睡眠监测系统1套；美国PB呼吸机8台；进口无创BiPAP呼吸机5台；高频呼吸机1台；心电监护仪10台，Philips 双向电流除颤器1台、巴德活检枪1套等。呼吸实验室具备开展分子生物学，细菌学、细胞培养等基本的仪器设备。
　　专科特色：对慢性阻塞性肺疾病，支气管哮喘，肺癌，肺栓塞，各种肺部感染性疾病：包括重症肺炎、免疫抑制合并肺部感染，胸膜疾病、甲型H1N1流感、慢性咳嗽的诊治、大咯血、呼吸衰竭的救治及各种呼吸系统疑难少见病包括：间质性肺疾病，系统性血管炎，肺泡蛋白沉积症、肺出血肾炎综合症等的诊治方面具有丰富的经验。并先后开展经B超或CT引导经皮肺针吸活检，经支气管镜肺活检，经支气管镜纵隔淋巴结或肿块针吸活检，经支气管镜球囊扩张、微波治疗，经支气管镜放射性粒子植入治疗中央型肺癌，内科胸腔镜、无痛支气管镜、全麻下全肺支气管肺泡灌洗治疗肺泡蛋白沉积症等新技术。