菏泽市立医院眼科成立于1946年，是集眼科外科，眼科内科，眼科整形为一体的综合性科室，现有开放性床位32张。
本科室有医护人员27人，其中主任医师（教授）3人，副主任医师（副教授）4人，主治医师6人，住院医师1人。护理人员14人。
　　眼科拥有裂隙灯显微镜、眼科A/B超、视野计、非接触及接触眼压计、直接及间接眼底镜、全自动电脑验光仪、带状光检影镜、线状镜、三棱镜、前房角镜、三面镜、多功能弱视治疗仪、同视机，眼电生理检查仪，眼底激光治疗仪，超声乳化仪、玻璃体切割机、眼底荧光造影。高精手术显微镜2台，准分子激光治疗仪等仪器设备。

眼科开展的主要项目：
　　1、 成人及小儿医学验光、配镜、斜视保守及手术治疗，弱视诊断治疗。
　　2、 早产儿视网膜病变筛查、高危儿眼底筛查。
　　3、 角结膜病、复杂性眼外伤、各种工农业化学性烧伤的抢救及诊断治疗。
　　4、 麦粒肿、散粒肿切除，上睑下垂矫正术，眼睑内外翻、倒睫矫正术，眼外伤手术，眼表重建、眼睑成形术等。眼球摘除+羟基磷灰石植入。眼眶各种肿物切除、眼眶重建术。
　　5、重睑术，眼袋切除术及其他整形美容手术。
　　6、翼状胬肉切除联合角膜缘干细胞移植或自体结膜移植、结膜肿物切除术，羊膜移植术、角膜移植术
　　7、 鼻腔泪囊吻合术，泪小管断裂吻合。泪道再通术等泪道手术。
　　8、各种抗青光眼手术（睫状体冷凝术，小梁切除，虹膜周切术等） 。
　　9、小切口白内障囊外（内）摘除术，白内障超声乳化术+人工晶体植入术。玻璃体切割术。球内异物取出术
　　10、眼底病及葡萄膜病的诊断及治疗，眼底荧光照影，各种眼底疾病的激光治疗。视网膜脱离修复术 ，视网膜肿物治疗。
　　11、全身性疾病（高血压，糖尿病，风湿病等）所引起的眼部并发症的诊断治疗。
　　12、急慢性视神经炎的抢救及诊断治疗、各种创伤性、中毒性视神经损伤的抢救治疗。
　　13、准分子激光治疗近视。