支原体肺炎主要是应用抗菌药物治疗，疗程多为2周左右。肺炎支原体无细胞壁，故常用的青霉素、头孢菌素类抗菌药物无效，而有效的药物主要有大环内酯类抗菌药物（如红霉素、阿奇霉素）及氟喹诺酮类药物（如左氧氟沙星、莫西沙星）。大环内酯类抗菌药物，尤其是阿奇霉素，治疗效果优于红霉素，而且对血管刺激小，消化道反应如腹泻、腹痛、稀便、恶心、呕吐少，被认为是肺炎支原体肺炎的首选药。    支原体感染可以造成小流行，故应注意呼吸道隔离，保持室内空气新鲜。由于咳嗽是支原体肺炎最突出的临床表现，频繁而剧烈的咳嗽可能影响患者的睡眠和休息，可适当给予小剂量镇咳剂，如可待因。祛痰治疗能促使痰液变稀薄，易于排出，减少合并细菌感染机会。病情严重有缺氧表现者应及时给氧。除对喘憋严重者，可选用支气管扩张剂如氨茶碱口服。对急性期病情发展迅速严重的支原体肺炎或肺部病变迁延而出现肺不张、肺间质纤维化、支气管扩张或有肺外并发症者，可适当应用肾上腺皮质激素。饮食以易消化、营养丰富的食物为宜并注意补充足够的液体。