1.X线检查
内生性软骨瘤的X线表现为干骺端的圆形或卵圆形低密度病灶，位于中心，占据整个髓腔，在骨破坏透亮区中可见到钙化。在短管状骨可侵及整个骨骼，呈梭形膨胀，在长骨肿瘤组织可侵入骨皮质的内缘产生沟嵴。多发性内生性软骨瘤病灶常见于干骺端，早期表现为干骺端不规则增宽，内有斑点状和条状钙化。
2.放射性核素扫描
内生性软骨瘤做放射性核素扫描示活跃的2期放射性核素摄取量增多，恶变时，放射性核素摄取量明显增加。
3.CT检查
内生性软骨瘤的CT切面可见膨胀性改变，低密度灶，中心有斑点状钙化灶。
4.MRI检查
内生性软骨瘤的MRI示在T1加权像上呈低信号，病灶呈长圆形或卵圆形的多房状，边界清楚，在T2加权像上为明显的高信号，内部的钙化为低信号。增强后可呈环形或不规则形强化。
5.病理检查
（1）肉眼所见
  内生性软骨瘤为蓝灰色分叶状，可有黏液样变性区及白垩色小颗粒状钙化点，与骨和骨髓交界处有一层界限清楚的皮质骨样反应层。
（2）镜下所见
  内生性软骨瘤形成分叶状结构，细胞较丰富，一个陷窝内往往有两个细胞，在病灶的外围，小叶的周围有一薄层由软骨内化骨生成的成熟骨。恶变为低度恶性软骨肉瘤的组织学征象是：呈结节样和簇样分布的外围软骨细胞突然变成片状排列的较幼稚细胞，细胞质较少，可见双核细胞，偶见有丝分裂。