及时治疗是改善狼疮性肾炎患者预后的关键。一般来讲，狼疮性肾炎Ⅰ型，不需要特殊治疗，但要随访观察。狼疮性肾炎Ⅱ型，Ⅱａ型者仅有一些轻度系膜病变，可不用治疗，Ⅱｂ型病变，同时伴蛋白尿超过１克／２４小时，血清中高滴度的抗－ｄｓＤＮＡ以及低Ｃ３补体血症者，可予激素治疗。
狼疮性肾炎Ⅲ和Ⅳ型者，治疗方案相同，预后相似，由于其１０年内的终末期肾病发生率高达５０％以上，故应进行加强治疗。
临床实践表明，联合应用细胞毒药物较单纯用激素治疗效果更好。多数学者认为，大量蛋白尿伴肾炎综合征、高血压、治疗前血肌酐已升高者，预后不好。病理改变与预后的关系最为密切。Ⅰ和Ⅱ型一般不发展为终末期肾病，Ⅲ型可有病情活动性发作，但治疗效果好。Ⅳ型病情多危重，但如及时、正确治疗，５年生存率可达８０％。