临床上对肥胖性心肌病的诊断没有一个大家认可的标准，如果一个人体重过胖，而且发生心脏扩大及心功能不良症状，在排除其它心肌病的情况下就可以诊断。但是这些条件不是很好掌握，所以临床上诊断“肥胖性心肌病”比较谨慎。常用的辅助检查与其它心肌病的一样，另外血气分析，多提示有呼吸性酸中毒。
关于鉴别诊断：因为诊断标准不具特点，所以鉴别诊断比较困难，临床上有一些病，如睡眠呼吸暂停综合征的病人，大多肥胖，且有不同程度的心脏结构和功能改变，在许多方面同肥胖性心肌病相似，相对而言，睡眠呼吸暂停综合征的诊断率就比肥胖性心肌病高，因为睡眠呼吸暂停综合征有明确的诊断标准。事实上，有人观察4例睡眠呼吸暂停综合征的病人，其临床表现和症状与肥胖性心肌病完全一样，而且也符合肥胖性心肌病的诊断条件。这两种病之间的关系是互为因果还是伴随疾病有待进一步研究探讨。
实际生活中肥胖的人很多，但真正患肥胖性心肌病的并不多见。肥胖性心肌病的特点有以下几点：身体过于肥胖，明显超重；血压偏高；行动不便每当体力活动时就出现心慌、气短等；心脏扩大，属于心肌改变；临床症状及心脏扩大不能用其它理由解释；肺部有淤血征象；心电图异常。