起病缓慢，潜伏期约2~3周，病初有全身不适，乏力、头痛。2~3天后出现发热体温常达39℃左右，可持续1~3周，可伴有咽痛和肌肉酸痛。
咳嗽为本病突出的症状，一般于病后2~3天开始，初为干咳，后转为顽固性剧咳、常有黏稠痰液偶带血丝，少数病例可类似百日咳样阵咳。可持续1~4周。肺部体征多不明显，甚至全无。少数可听到干、湿啰音乐。但多块消失，故体征与剧咳及发热等临床表现不一致，为本病特点之一。婴幼儿起病急，病程长，病情较重，表现为呼吸困难、喘憋、喘鸣音较为突出，肺部啰音比年长儿多。部分患儿童可患有溶血性贫血，脑膜炎、心肌炎、呻吟、格林-把利综合征等肺外表现。

需综合临床症状、X线表现及血清学检查结果作出诊断。培养分离出肺炎支原体虽对诊断有决定性意义，但其检出率较低，技术条件要求高，所需时间长。血清学试验有一定参考价值，尤其血清抗体有4倍增高者。本病应与病毒性肺炎、军团菌肺炎等鉴别。外周血嗜酸性粒细胞数正常，可与嗜酸性粒细胞增多性肺浸润相鉴别。
1.X线胸片
为肺纹理增多，肺实质呈斑点状，斑片状或均匀模糊阴影。
2.病原学检查
痰、鼻和喉拭子培养查肺炎支原体。
3.血清学检查
血清病原抗体效价>1:32、链球菌mg凝集试验，效价≥1:40为阳性，连续两次4倍以上增高有诊断价值。
周围血白细胞总数正常或稍增多，以中性粒细胞为主。起病后2周，约2/3病人冷凝集试验阳性，滴定效价大于1:32,特别是当滴度逐步升高时，有诊断价值。约半数病人对链球菌mg凝集试验阳性。诊断的进一步证实有赖于血清中支原体igm抗体的测定(酶联免疫吸附试验最敏感，免疫荧光法特异性强，间接血凝法较实用).抗原检测可用pcr法，但试剂药盒还有待改进，以提高敏感性和特异性。

本病轻型须与病毒性肺炎、军团菌肺炎相鉴别。病原体分离阳性和血清学试验对鉴别诊断很有帮助。周围血嗜酸粒细胞正常，这与嗜酸粒细胞增多性肺浸润亦有所鉴别。