感染性疾病诊疗与研究中心下设2个临床科室和1个研究室，主攻方向为急性肝病、艾滋病、各种新发、突发感染性疾病的中西医结合诊断、治疗与研究。收治范围“广”而“全”，尤其擅长呼吸道、消化道传染病、中枢神经系统感染、发热待查及人畜共患病等传染病的诊治，收治病种多达30余种，收治患者年平均2000余人次，在军内外享有很高的知名度。
　　中心是全军艾滋病诊治与会诊中心，在艾滋病抗病毒治疗以及各种机会性感染的诊疗方面特色突出。从1990年收治中国大陆第1例艾滋病患者开始，至今已诊治军地HIV/AIDS患者300余例次。2005年获得SFDA颁发的感染性疾病和艾滋病专业药物临床试验机构的资格，并完成多个艾滋病和病毒性肝炎治疗药物的II、III期临床试验。
　　同时，中心还负责全军疑难、重症传染病的会诊及转诊任务，承担院内外各种传染病的会诊和中央领导出访时传染病防治的保障任务。是传染病临床教学基地，承担着北京大学医学部传染病学授课任务以及所有临床见习、实习任务，每年接收进修医生的数量为医院之最。
　　[主要业绩]
　　成功处置20余起军队突发公共卫生事件，在该领域逐渐树立权威地位，出色完成98抗洪、5.12汶川和青海玉树抗震救灾、奥运安保、海地救援、援非抗疟中心筹建以及联合国维和行动等重大事件的传染病防控工作。在2003年抗击传染性非典型肺炎的战役中，中心全体医护人员将个人安危置之度外，为北京市及时、有效控制“非典”作出了突出的贡献。在应对甲型 H1N1流感的战斗中，收治患者400余例，其中重危患者近20例，全部治愈出院。中心先后荣获集体二等功、全国三八红旗单位、四总部表彰的全军防治“非典”工作先进单位等荣誉称号。
　　[专家团队]
　　中心设主任1人，副主任3人，拥有2个医疗单元和护理单元，医师包括主任医师2名，副主任医师3名，副主任技师1名，主治医生11名、住院医生5名；护师包括副主任护师1名，主管护师6名。其中博士后1名、博士4名、硕士7名、在读博士3名，在读硕士4名。