莆田学院附属医院儿科久负盛名，是我市技术力量最雄厚、设备最齐全的重点学科。科室开放床位80张，下设新生儿、神经系统、呼吸系统、泌尿系统、血液系统、心血管系统等6个专业，设有省内综合医院首家、市内独家的儿科危重监护病房(其中：NICUl0床，PICU8床)和市内首家脑瘫康复室。年门诊量8万多人次，年收住患儿近4000人次，年抢救急、危、重患儿400余例，抢救成功率在95%以上。该科技术力量雄厚，现有医护人员53名，其中主任医师3名、副教授2名、副主任医师6名、主治医师3名，医学硕士1名、主管护师8名，护师19名；设备齐全，配有婴儿高压氧舱、呼吸机、心电监护仪、远红外线辐射抢救台、保温箱、输液泵、推注泵、转运暖箱等各种现代化医疗设备；在治疗新生儿、小儿常见病、疑难病和危重病方面，特别是早产儿低体重儿诊治、新生儿重度窒息、新生儿重度缺氧缺血性脑病抢救、蒙被综合征、重症肺炎、晚发性维生素K缺乏症、癫痫持续状态、格林一巴利及多功能脏器衰竭等疾病救治等积累了丰富的临床经验，成功率达95％以上，整体技术水平居市内之首，部分技术达省内先进水平；该科不断追踪儿科医学发展新进展，积极开展新技术、新项目，在市内率先开展并推广“小儿癫痫的系统治疗”、“早产儿静脉营养”、“复方丹参、纳络酮在新生儿窒息及缺氧缺血性脑病中的应用”、“丙戊酸钠、西比灵治疗儿童偏头痛”、“复方丹参、维生素K1治疗婴幼儿肺炎伴心力衰竭”等新疗法，取得了良好的疗效。

莆田学院附属医院骨科是医院的重点学科，也是莆田市医学会骨科分会和莆田学院骨科研究所挂靠单位，设有脊柱、关节、创伤等专业。本科实际开放床位60张，拥有雄厚的技术力量和先进的医疗设备。现有医护人员24名，其中：教授1名、研究生导师1名、高级职称7名、中级职称6名，硕士研究生6名。拥有进口的C臂X光机、椎间盘镜、关节镜等高精尖手术设备，最大限度地保证了手术的精确和完美。近年来，本科医务人员先后获得市科技进步一等奖两项、二等奖一项，出版专著两部，发表国家级论文三十余篇。

莆田学院附属医院妇产科是治疗妇科和产科常见病、疑难病、危重病的科室、学科专业技术力量强。现有主任医师2人，副主任医师5人，主治医师4人，住院医师7人。设有妇科和产科二个专科，开设65张床位。在市内率先开展腹腔镜、宫腔镜、中心与远程胎心监护等现代化诊断治疗。

莆田学院附属医院中医科创建于1957年，久负盛名，名医辈出，是我院的特色科室，也是福建中医学院硕士研究生培养点。设有中医内科、中医妇科、中医男性科、中医老年病科、中医肛肠科等，开放床位24张，年门诊量4.5万余人次。学科专业技术力量雄厚，现有医务人员22人，其中主任中医师3人（包括教授1名，副教授1名，硕士研究生导师1名），副主任中医师1人，中级医护人员8名。该科突出中医特色，继承与发展并举，把整体观、辨证论治等中医理论与现代医学紧密结合，采用中医、中西医结合等诊治各种内科常见病、多发病及疑难杂病，尤其在肝胆疾病、肾脏疾病、脾胃疾病、老年心肺血管疾病、妇科病、男科病、风湿病、糖尿病及其慢性并发症等取得较满意疗效。同时努力开展中医特色的教学、科研，承担福建医科大学、福建中医学院、莆田学院、莆田市医师培训、进修等教学任务。全科医护人员在国家级、省级医学刊物上发表学术论文40余篇，其中有2篇获得莆田市自然科学优秀论文一等奖，出版专著1册，目前有2项科研获得市（厅）级立项。

莆田学院附属医院口腔科设有口腔内科、口腔颌面外科、口腔修复专科和口腔正畸专科等专业，实际开放床位12张，配备有雄厚的技术力量和先进的医疗设备。现有医师11名，其中，副教授1名，副主任医师4名，主治医师2名，硕士研究生2名。为防止疾病的交叉感染，科室还配有2名专业医务人员从事口腔器械消毒工作。目前，科室拥有先进的牙科综合治疗椅7台，高压灭菌机2台及牙科X光机、光固化机等高精尖医疗设备，最大限度地保证了门诊各种治疗的精确和完美。科室医务人员率先在我市开展具有国际先进水平的Profile机用根管塑形和Thermafil根管充填技术，牙髓病根管治疗也已达省内领先水平。同时，科室成功完成《三叉神经痛的临床手术治疗》科研课题，填补了省内该项技术的空白。近年来，科室医务人员先后在国家级、省级医学刊物上发表论文数十篇。

莆田学院附属医院眼科已有20余年历史，是莆田市最早设立的眼科专科，久负盛名，名医辈出。科室集医疗、科研和教学于一体，整体技术力量雄厚，拥有主任医师2名，副主任医师1名，医师2名，负责眼科各种疾病的诊治工作。各种检查、治疗设备先进齐全，配备有先进的显微镜、超声乳化仪、验光仪、非接触眼压仪、眼A、B超，角膜曲率仪、眼电生理仪、YAG激光机、双目检眼镜等多种眼科先进设备。能够开展白内障、青光眼、眼底出血玻璃体切割、视网膜脱离、复杂眼外伤、义眼座植入、斜视、睑内外翻、泪囊鼻腔吻合，眶壁骨折修复等多种手术。科室医务人员不断追踪学习眼科领域的先进技术、方法，精益求精，努力进取，在莆田眼科领域里创造了“五个第一”：为莆田市最早独立设置的眼科专科；为莆田市独家依靠自身技术力量完成白内障超乳化术的科室，技术水平达国内国际先进水平，并被定为白内障复明工程指定单位；在莆田市率先开展角膜移植手术、复杂视网膜脱离手术；科室开展的经鼻泪道置管术，成功率高，为全市首创，技术水平领先；斜视弱视的矫正技术处于全市领先水平。

莆田学院附属医院整形整容专科是为适应社会需要避免该专业因不正规的商业行为给人们带来的巨大的、不可弥补的伤害而创立，培养一批高素质、外科经验丰富的正规整形整容专业人才，以高超的外科技巧，熟练的技术操作，为人们创造个性化的美。 　　莆田学院附属医院整形整容外科开展：重睑术、祛眼袋手术、眼裂开大术、肿泡眼整复术，上睑下垂整形术，内眦赘皮切除术，上下睑外翻整复术、眉整形术、隆鼻术、鼻畸形整复术、耳廓畸形整形术，耳再造术，厚唇修薄术，隆下颏术，下颌角切除术，面部除皱术。隆乳术巨乳缩小术，乳房下垂整形术，乳头内陷整形术，乳头缩小术，处女膜修补术，阴道缩紧术，抽脂减肥术，祛斑术，唇裂腭裂修补术，多指、并指整形术，各种面部肿物切除整复术，狐臭切除术，各种烧伤疤痕植皮整形术等。