骨科是国家中医药管理局肺外结核专病建设单位、南京市中医重点专科。主要承担全国范围内骨与关节结核诊治、城东地区及周围郊县骨伤急救处理、骨肿瘤、骨病治疗工作。并建有骨结核、腰腿痛、关节炎专科。该科应用中西医结合方法治疗骨与关节结核已有30多年历史，在手术病灶清除的基础上，应用中药清热解毒、活血化瘀、内外兼治的方法，治疗骨与关节结核及脊柱结核合并截瘫疗效显著。对胸、腰椎结核形成的寒性脓肿及复杂性窦道、瘘管探索了一整套系统的中西医结核治疗方法。结核性窦道是目前医学界中一大顽症，该院应用中药“拔瘰丹”及“窦愈灵”外用治疗久治不愈的窦道，杀菌生肌、拔管祛腐、闭合窦道、配合“骨痨片”、“骨痨汤”内服，扶正固本，增强免疫力，均达痊愈出院，为3000余例重症骨与关节结核患者解除了病痛。
　　骨科近10年来根据不同的适应症，选择不同的方法治疗腰椎间盘突出症，取得满意疗效。应用三维牵引加中药熏蒸、经皮穿刺髓核旋切法、小切口开窗法髓核摘除术治疗腰椎间盘突出症5000多例，深受南京市及周边省市患者的欢迎。现已形成中西医结合系列化治疗慢性腰腿痛、颈椎病，使病人免受手术之苦。目前该科引进了国际先进的手术牵引床，C型臂X光机，开展了脊柱内固定系列治疗胸、腰椎暴裂型骨折及截瘫的治疗，一期双侧人工全髋关节置换术。