生殖内分泌科成立于2012年9月，是院在妇产科和泌尿科学科强劲发展基础上，为了更好诊治不孕不育和妇科内分泌疾病而设立的新兴科室。建科当年即通过国家评审，成为省为数不多的获准开展辅助生殖技术的专科。科室人才荟萃、年轻有为、朝气蓬勃，医生中2/3以上具有博士学位。科室骨干在学术团体的任职有：浙江省生殖医学分会常委、浙江省医学遗传学分会委员、浙江省出生缺陷预防与控制专业委员会委员、英国医学杂志（BMJ）特约审稿人、国际骨质疏松协会成员。科室具有较强的科研和教学实力，目前主持国家和省自然科学基金、省卫计委科研项目7项，近3年来在国际刊物发表SCI论文7篇，承担浙江省中医药大学和杭州师范大学医学生的妇产科教学，主办国家级继续教育项目“不孕不育的预防和治疗新策略”。
　　科室由临床、实验室、护理三支优秀队伍组成。主诊医生和生殖实验室成员有长期从事辅助生殖的临床工作经验，拥有数千例辅助生殖周期和上万例胚胎操作经验，已成功为许多家庭送去了新生命。目前科室保持着较高的促排卵和人工授精抱婴率。开展的不孕不育微创手术，如各种宫腹腔镜手术治疗重度子宫内膜异位症、卵巢巧克力囊肿、子宫肌瘤、输卵管整形、子宫内膜息肉、宫腔粘连、子宫纵隔等，术后也获得了非常高的妊娠率。男科开展输精管吻合、精索静脉曲张和男性生殖器畸形矫正手术，对性功能障碍处理经验丰富。
科室开展一站式诊疗服务，如对不孕患者进行不孕查因－治疗－孕期跟踪－生育后随访的连续长期服务。不仅进行细致的不孕病因分析，设计合理的促孕治疗策略，还会根据患者的病情所需进行合理的内科、外科、产科和中医科转诊联系，整合治疗，为患者提供便捷的优质医疗。
　　不孕不育的诊治：针对各种男女不孕不育症开展全面的评估、诊断及治疗。检查包括：生殖内分泌检查、排卵监测、输卵管通畅性检查、精液分析、染色体遗传学、生殖免疫检验、宫腹腔镜探查等；实施各种维护生育功能的手术，包括子宫肌瘤剔除、卵巢囊肿剥除、子宫内膜异位症、输卵管粘连分离再通、宫腔粘连分离、宫腔畸形校正等宫腔镜、腹腔镜手术；开展各种促进生育的助孕技术，如促排卵治疗、人工辅助生殖等；进行各种优生优育指导，如遗传咨询、复发性流产查因和保胎治疗等；开设男性不孕专科门诊。
妇科内分泌疾病的诊治：主治各种月经失调、闭经、青春期性发育异常、更年期综合征、多囊卵巢综合征、卵巢早衰、高泌乳素血症、性激素相关肿瘤等。开展更年期保健、妇科内分泌疾病的长期跟踪随访治疗。
　　临床研究关注重点是：多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症性不孕症、辅助生殖并发症、绝经期激素补充治疗、绝经期肥胖和骨质疏松。基础科研方向是：卵子质量、胚胎着床机制及雌激素作用机理。研究成果已发表在中英文论文数十余篇，最高影响因子5.0分。