福州总院中医科门诊以传统中医药、结合现代医学技术为特色，设八个专科，开展项目如下：
　　1、 中医内科：主攻久咳，顽喘，慢性腹泻、肾病，脾胃病，老年病，癫痫等疑难杂病。
　　2、 痔疮科：以注射疗法结合小手术治疗各种肛肠疾患，疗效确切，方法方便。
　　3、 痛症科：颈椎病，腰间盘突出症，骨质增生，肩周炎，腰背肌劳损，四肢关节活动受限，网球肘，坐骨神经痛，骨折、脱位（畸形愈合）后遗症，颈、肩、四肢、腰腿痛（股骨头无菌性坏死、强直性脊柱炎），急、慢性损伤，其它相关骨伤科疾患。
　　4、 男科：男性不育症及部分女性不孕症，阳痿、早泄等男性性功能障碍，淋病及各种泌尿道感染，睾丸炎、副睾炎、包皮炎等男性生殖器炎症，阴囊瘙痒、湿疹等男性生殖器及邻近部位的皮肤病，其它杂病。
　　5、 针灸科：面瘫，耳呜、耳聋，麦粒肿，头痛，失语，失眠，落枕，颈椎病，肩周炎，急、慢性腰扭伤，腰肌劳损，尿失禁，尿潴留，坐骨神经痛，截瘫，偏瘫，胃脘痛，呃逆，各种神经损伤。
　　6、 推拿科：主攻腰椎间盘突出症，腰肌劳损，肩周炎，急、慢性腰扭伤、颈椎病等。
　　7、 前列腺专科：以前列腺被膜下注射治疗慢性前列腺炎，前列腺增生等前列腺疾病。
　　8、 理疗科：理疗中的许多物理因子对人体具有镇痛、扩张血管、加强血循环的作用；抗过敏、促进伤口愈合的作用；还有抗痉挛及防治下运动神经元损伤后的肌萎缩的作用。详细情况请见"更多内容"下的理疗科简介。