五官科于1948年设立。人民政府接管医院后撤并在外科。1952年再设立五官科，不久又撤并。1959年又再设立，但仍与外科合在一起，不久后又成为独立科室。2007年7月改制为一病区，病床25张，医护人员18人，其中副主任医师3人，主治医师2人，住院医师3人，学科带头人陈国强副主任医师。
　　20世纪60年代初期，五官科开展兔唇修补、上颌窦根治、扁桃线摘除、鼻息肉摘除、眼球摘除等手术，并购进一台中波电疗机。70年代初期开展眼底镜检查、眼外伤修补等技术。70年代后期，开展鼓膜修补、乳突根治、眼球内异物取出、泪囊鼻腔吻合、抗青光眼、白内障冰冻摘除等手术。
1984年，对白内障手术进行改革，以往多用冷冻摘除，既经济又方便，不受气温限制，一年四季都可施行，并获得良好效果。
　　1988年开展间接喉镜下喉部肿物摘除术。
1990-2009年五官科开展新技术、新项目有：支撑喉镜下声带新生物摘除显微手术；鼓室成形术：结膜瓣翻转泪道成形术；耳鼻咽喉科激光治疗技术；鼻腔恶性肿瘤切除术；改良乳突根治术+Ⅰ期听力重建术治疗残耳；高压舱治疗突发性耳聋眼底疾病；白内障现代囊外摘除术+人工晶体植入术；前鼻孔闭锁整形术；口腔粘膜移植修补眼球结膜缺损；耳科显微外科技术；耳鼻咽喉科微波治疗术；斜视弱视诊疗术；颌面骨骨折整复内固定；屈光不正验光配镜技术；耳科听力测试技术；鼻窦内窥镜外科技术；小切口甲状腺手术和甲状腺癌联合根治术；口腔恶性肿瘤切除+带血管蒂皮瓣修复手术；颈部淋巴结清扫术及喉部分切除+修复手术等头颈部肿瘤的外科治疗技术。
　　《白内障囊外摘除术+人工晶体植入术》获1998年安溪县科技进步三等奖。
　　《儿童弱视的防治》获2001年安溪县科技进步三等奖。